More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1740 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  322  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  77.46 
 
 		 151 aa  222  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  47.97 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  40.14 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  43.57 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  39.57 
 
 		 339 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 293 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 293 aa  77.8  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  40.71 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  34.19 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 298 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 291 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  37.23 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  39.87 
 
 		 292 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.62 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  37.96 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  34.51 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  35.21 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.36 
 
 		 288 aa  68.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  36.88 
 
 		 302 aa  67.4  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 277 aa  67.8  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  35.92 
 
 		 313 aa  67.4  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 294 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 		 289 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  37.93 
 
 		 289 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  33.58 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  33.56 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  36.43 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  36.94 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  33.13 
 
 		 381 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  34.29 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  33.79 
 
 		 317 aa  65.1  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.14 
 
 		 288 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  35.21 
 
 		 293 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 293 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  32.68 
 
 		 305 aa  64.7  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  33.1 
 
 		 287 aa  64.7  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  35.97 
 
 		 303 aa  64.3  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  33.12 
 
 		 322 aa  64.7  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  36.23 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 		 288 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 293 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  34.31 
 
 		 348 aa  64.3  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  36.62 
 
 		 294 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 294 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.81 
 
 		 284 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 294 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  32.86 
 
 		 291 aa  63.9  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  50.67 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0344  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  32.87 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  39.33 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2802  UspA domain protein  42.55 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  30.71 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  34.69 
 
 		 293 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  34.72 
 
 		 285 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  34.62 
 
 		 307 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 290 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  34.42 
 
 		 296 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  36.49 
 
 		 309 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  34.25 
 
 		 288 aa  60.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.07 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  33.33 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  30.82 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  32.37 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.33 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  35.46 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  32.17 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  33.57 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  32.93 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  31.51 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  32.88 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  31.33 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  34.04 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>