277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0009 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  100 
 
 
321 aa  650    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  31.75 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 
381 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 
289 aa  95.9  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  31.55 
 
 
288 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  32.38 
 
 
273 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4449  hypothetical protein  30.43 
 
 
311 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 
294 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  30.49 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  30.49 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  28.53 
 
 
295 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  29.78 
 
 
295 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  29.78 
 
 
295 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  29.78 
 
 
295 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  30.09 
 
 
296 aa  85.9  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  29.6 
 
 
293 aa  85.9  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  31.4 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  28.92 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  28.92 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  28.92 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  30.94 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  33.18 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  27.13 
 
 
341 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  28.53 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  26.83 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  26.83 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  27.66 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  27.85 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  28.16 
 
 
299 aa  79  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  29.14 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  27.96 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  28 
 
 
293 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  28 
 
 
293 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  26.3 
 
 
293 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  29.34 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  26.99 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.45 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  42.14 
 
 
146 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  26.65 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  27.83 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  26.77 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  31.46 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  30.51 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  29.41 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  29.46 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  25.95 
 
 
290 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  26.81 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3300  UspA domain protein  30.22 
 
 
284 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176121  normal  0.0128083 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  26.52 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  28.88 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  28.88 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  26.51 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  28.88 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  33.82 
 
 
161 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  28.16 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  29.97 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  33.99 
 
 
155 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  28.09 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  29.78 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  27.5 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  28.62 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  28.57 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  32.14 
 
 
143 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  26.65 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  27.04 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  31.23 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  28.79 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  29.15 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  28.79 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  28.79 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  29.36 
 
 
275 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  27.02 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  27.27 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  26.81 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  25.22 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  26.18 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  27.19 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  38 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.82 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
291 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 
293 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
155 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  26.2 
 
 
309 aa  63.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  36.69 
 
 
147 aa  63.5  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  26.71 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  26.93 
 
 
297 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  28.57 
 
 
283 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  25.89 
 
 
294 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  28.48 
 
 
324 aa  62.8  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  26.63 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4144  UspA domain protein  29.46 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  27.35 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
144 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>