More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3812 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  100 
 
 		 143 aa  280  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  46.32 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  47.14 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  43.94 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  48.53 
 
 		 183 aa  101  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  45.71 
 
 		 339 aa  101  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  43.7 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  42.55 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  46.32 
 
 		 303 aa  97.4  6e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  43.38 
 
 		 293 aa  95.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  44.37 
 
 		 294 aa  94.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  40 
 
 		 317 aa  94  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 159 aa  94  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  45.19 
 
 		 324 aa  92.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  46.1 
 
 		 321 aa  92  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  43.57 
 
 		 306 aa  91.7  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  42.86 
 
 		 289 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  42.03 
 
 		 308 aa  90.9  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  42.14 
 
 		 294 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  38.62 
 
 		 287 aa  89.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  42.14 
 
 		 294 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  42.14 
 
 		 294 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  42.34 
 
 		 305 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  39.26 
 
 		 289 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  40.74 
 
 		 288 aa  88.6  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  37.78 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 296 aa  88.2  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 		 296 aa  88.2  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 		 343 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 		 293 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  41.3 
 
 		 296 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2137  UspA domain-containing protein  43.7 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.221576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  40 
 
 		 299 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  37.14 
 
 		 345 aa  86.3  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  38.03 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2072  UspA domain protein  37.59 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000584159 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 		 188 aa  85.5  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  39.72 
 
 		 305 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  40.15 
 
 		 347 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  37.84 
 
 		 170 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  39.72 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  36.43 
 
 		 341 aa  84.7  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  41.84 
 
 		 276 aa  84  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  40.41 
 
 		 300 aa  84  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  40.71 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  43.18 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2071  UspA domain protein  44.78 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000068593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  35.98 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 297 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  40.43 
 
 		 348 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  38.69 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  42.03 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.77 
 
 		 288 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 291 aa  80.5  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  40.58 
 
 		 286 aa  80.1  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  42.96 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  38.52 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  37.68 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  41.96 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  37.31 
 
 		 289 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  38.17 
 
 		 294 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  41.84 
 
 		 292 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  35.66 
 
 		 308 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  38.17 
 
 		 294 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  41.84 
 
 		 292 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  40.3 
 
 		 277 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  38.17 
 
 		 294 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  41.84 
 
 		 292 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1798  UspA domain protein  35.82 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.104152  normal  0.0257832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  40 
 
 		 288 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2076  UspA domain protein  39.42 
 
 		 288 aa  77.4  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000523468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2802  UspA domain protein  43.48 
 
 		 174 aa  77  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  40.15 
 
 		 283 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  39.1 
 
 		 282 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  37.68 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  44.6 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.71 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  41.43 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  42.65 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  38.17 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  38.17 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  38.17 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 		 298 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  37.78 
 
 		 292 aa  74.7  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  39.42 
 
 		 290 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.97 
 
 		 288 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  41.84 
 
 		 301 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  40.28 
 
 		 310 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 289 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  38.52 
 
 		 287 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  37.23 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 289 aa  73.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 		 293 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 		 341 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 293 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  37.96 
 
 		 296 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  37.31 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>