More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5277 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  100 
 
 
308 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1638  UspA domain protein  52.81 
 
 
308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  48.22 
 
 
302 aa  225  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  46.28 
 
 
321 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  40.26 
 
 
307 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  42.2 
 
 
305 aa  162  9e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  35.71 
 
 
317 aa  140  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  38.06 
 
 
305 aa  139  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.28 
 
 
299 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  37.25 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  35.62 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  35.64 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  35.67 
 
 
306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  36.27 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  35.41 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 
293 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  35.78 
 
 
308 aa  125  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 
288 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  36.52 
 
 
277 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  40.4 
 
 
300 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.11 
 
 
288 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  35.41 
 
 
303 aa  123  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  38.44 
 
 
283 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  34.45 
 
 
291 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
297 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  35.39 
 
 
298 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  37.07 
 
 
294 aa  119  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  35.67 
 
 
341 aa  119  6e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  38.32 
 
 
310 aa  119  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  36.12 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  32.23 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  35.03 
 
 
288 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 
292 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  35.91 
 
 
296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  35.06 
 
 
298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  36.03 
 
 
292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 
298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 
292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  34.08 
 
 
297 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  35.35 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  35.25 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  37.09 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  34.54 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  34.56 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  34.54 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 
293 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  32.46 
 
 
294 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  33.22 
 
 
295 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 
289 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.67 
 
 
284 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  32.46 
 
 
289 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  32.46 
 
 
294 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
295 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
295 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  36.82 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.76 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  33.45 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  33.9 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  34.35 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  33.9 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  33.9 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  34.56 
 
 
277 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  34 
 
 
293 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  31.8 
 
 
294 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4144  UspA domain protein  39.47 
 
 
307 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  33.78 
 
 
296 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  31.13 
 
 
295 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  30.51 
 
 
293 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  37.16 
 
 
313 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  32.66 
 
 
347 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  35.08 
 
 
314 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  35.57 
 
 
292 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  34.69 
 
 
277 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  37.54 
 
 
291 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  31.89 
 
 
289 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  35.76 
 
 
323 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2069  UspA domain protein  35.84 
 
 
288 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000374133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  31.67 
 
 
341 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  31.33 
 
 
341 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
341 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  34.94 
 
 
343 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 
290 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  35.41 
 
 
302 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  31.77 
 
 
294 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  32.66 
 
 
291 aa  99.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  35 
 
 
298 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  34.91 
 
 
348 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  33.91 
 
 
381 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
293 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  36.16 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  34.8 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  31.79 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  32.12 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  33.89 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  32.88 
 
 
273 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  28.62 
 
 
297 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>