More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0361 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  100 
 
 
293 aa  565  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  32.06 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  36.36 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  38.21 
 
 
308 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 
381 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  37.42 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  36.6 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  35.47 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  38 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  35.45 
 
 
295 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  35.33 
 
 
295 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 
295 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 
295 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  36.33 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  36.3 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  36.09 
 
 
293 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  36.09 
 
 
293 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.56 
 
 
288 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
294 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  33.11 
 
 
317 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  33.66 
 
 
294 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
294 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  35.43 
 
 
293 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.01 
 
 
299 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  35.23 
 
 
298 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  35.23 
 
 
298 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  33.66 
 
 
297 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  35.23 
 
 
298 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  35 
 
 
295 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  36.48 
 
 
343 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  33.44 
 
 
292 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  34.34 
 
 
293 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  35.43 
 
 
295 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  36.15 
 
 
293 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
296 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
293 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  45.83 
 
 
155 aa  99.4  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 
288 aa  99  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  31.89 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  29.77 
 
 
341 aa  97.4  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  31.37 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4449  hypothetical protein  35.42 
 
 
311 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  34.88 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  35.74 
 
 
321 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  36.54 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 
293 aa  93.6  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
289 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  37.09 
 
 
305 aa  93.2  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  32.36 
 
 
297 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  30.39 
 
 
341 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  30.07 
 
 
341 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
341 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  31.05 
 
 
290 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  34.48 
 
 
305 aa  89  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  34.22 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  31.05 
 
 
296 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  31.25 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  32.79 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  35 
 
 
294 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  32.79 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  29.43 
 
 
345 aa  86.7  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  30.46 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  31.97 
 
 
302 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  36.82 
 
 
298 aa  85.5  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  30 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  32.46 
 
 
292 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2802  UspA domain protein  43.79 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  30.36 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  31.08 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  33.67 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  31.42 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  34 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  33.45 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  32.79 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  32.24 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  30.13 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  31.99 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  31.56 
 
 
287 aa  79  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  32.01 
 
 
296 aa  79  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  31.06 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  29.7 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  29.47 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  29.8 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  29.97 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  40.15 
 
 
144 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  34.01 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  32.44 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  39.26 
 
 
164 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  34.2 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  34.59 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  37.56 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  31.33 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>