More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0948 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  100 
 
 
290 aa  570  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  44.48 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1997  UspA domain-containing protein  39.14 
 
 
386 aa  162  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 
289 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  35.94 
 
 
301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
294 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  34.48 
 
 
294 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
294 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  35.25 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
296 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  34.8 
 
 
288 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
296 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  35.4 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.17 
 
 
288 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  31.44 
 
 
347 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 
296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  34.03 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
293 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.26 
 
 
299 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  34.15 
 
 
288 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  33.56 
 
 
295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.11 
 
 
284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  33.68 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  31.48 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  32.65 
 
 
294 aa  113  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  31.48 
 
 
292 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  34.81 
 
 
373 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  31.48 
 
 
292 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  32.76 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  33.22 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  34.14 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  32.76 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
293 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 
289 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
294 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  35.96 
 
 
296 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  33.9 
 
 
296 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  32.88 
 
 
294 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
294 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 
294 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
277 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  35.21 
 
 
285 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  32.2 
 
 
295 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.86 
 
 
288 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  32.63 
 
 
293 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 
275 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  35.21 
 
 
282 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  29.55 
 
 
341 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  32.75 
 
 
299 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  29.47 
 
 
341 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  29.47 
 
 
341 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  34.84 
 
 
298 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
289 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  31.74 
 
 
314 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
295 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  31.6 
 
 
289 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  34.04 
 
 
273 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  32.47 
 
 
305 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  32.19 
 
 
298 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
298 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
298 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 
297 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  31.8 
 
 
302 aa  99.4  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  32.87 
 
 
323 aa  99.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  34.56 
 
 
288 aa  99  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  29.8 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  30 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  37.61 
 
 
229 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  32.23 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
287 aa  96.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  31.29 
 
 
303 aa  96.3  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  32.78 
 
 
303 aa  95.9  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  32.53 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  34.11 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  32.33 
 
 
302 aa  92.8  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  32.47 
 
 
317 aa  92.4  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  33.22 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0951  UspA domain-containing protein  30.03 
 
 
349 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  29.47 
 
 
304 aa  90.1  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  27.65 
 
 
345 aa  90.1  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  33.33 
 
 
321 aa  89.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  32.89 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  33.67 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  32.21 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  29.43 
 
 
306 aa  87  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  33.82 
 
 
393 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  31.74 
 
 
287 aa  87  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  33.94 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  30.63 
 
 
343 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>