277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1774 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  100 
 
 
164 aa  329  8e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  46.27 
 
 
155 aa  100  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  43.94 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  46.32 
 
 
155 aa  89.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  40 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  40.29 
 
 
144 aa  84.3  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  40.88 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  40.85 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  40.91 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  35.46 
 
 
345 aa  77  0.00000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  36.17 
 
 
341 aa  77  0.00000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  38.1 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  39.57 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  36.75 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  38.69 
 
 
288 aa  74.7  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  42.96 
 
 
303 aa  74.7  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  38.62 
 
 
302 aa  74.7  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  42.14 
 
 
293 aa  74.7  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
293 aa  74.3  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  38.69 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  35.33 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  39.01 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  38.97 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  39.44 
 
 
307 aa  70.9  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  37.76 
 
 
295 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
295 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
295 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  33.33 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  38.19 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18580  universal stress protein UspA-like protein  35.46 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  42.07 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 
289 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  39.74 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  36.69 
 
 
305 aa  68.2  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  36.42 
 
 
292 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 
292 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 
292 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  39.07 
 
 
293 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  36.88 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 
297 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.19 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  41.04 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2137  UspA domain-containing protein  38.97 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.221576  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.36 
 
 
288 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.36 
 
 
284 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  36.62 
 
 
305 aa  64.7  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  36.43 
 
 
315 aa  64.3  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  43.26 
 
 
288 aa  63.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 
295 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  35.37 
 
 
321 aa  63.9  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2072  UspA domain protein  36.03 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000584159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  38.97 
 
 
277 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  40.58 
 
 
288 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  34.25 
 
 
294 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 
343 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1902  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
166 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156681  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
294 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 
294 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  38.57 
 
 
159 aa  61.6  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  35 
 
 
322 aa  61.6  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  38.69 
 
 
323 aa  61.6  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  33.58 
 
 
287 aa  61.2  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  33.1 
 
 
308 aa  61.2  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  33.56 
 
 
306 aa  61.2  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 
293 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  35.77 
 
 
296 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 
290 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  36.03 
 
 
310 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 
289 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  36.36 
 
 
273 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 
296 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  37.86 
 
 
292 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  36.09 
 
 
277 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  34.39 
 
 
294 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  34.64 
 
 
294 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3045  hypothetical protein  35.71 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
291 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  37.86 
 
 
292 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  36.03 
 
 
288 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  44.2 
 
 
298 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  37.59 
 
 
305 aa  58.2  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  34.72 
 
 
293 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
293 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  34.07 
 
 
348 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  37.23 
 
 
296 aa  57.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  35.51 
 
 
286 aa  57.8  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  35.77 
 
 
170 aa  57.8  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  38.3 
 
 
283 aa  57.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  33.82 
 
 
296 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  35.11 
 
 
297 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  31.87 
 
 
301 aa  57.4  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>