More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1581 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 288 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  85.42 
 
 		 289 aa  484  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  42.61 
 
 		 287 aa  175  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  41.58 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  44.33 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.26 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  43.45 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  43.16 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  42.4 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  44.86 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.16 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  41.16 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  39.93 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  43.69 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  41.2 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  42.62 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  38.81 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  39.93 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  37.75 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  38.25 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  40.89 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  43.82 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  36.82 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  37.93 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 287 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  38.68 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  34.25 
 
 		 345 aa  139  4.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  39.37 
 
 		 293 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  36.96 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  39.02 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  34.97 
 
 		 341 aa  134  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  38.61 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  38.94 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  38.94 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  36.9 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  36.54 
 
 		 343 aa  132  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  36.9 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  36.93 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  42.76 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  36.11 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  37.81 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  40.93 
 
 		 229 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  39.81 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  38.36 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  35.05 
 
 		 347 aa  129  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  36.55 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  33.22 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  36.49 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  37.37 
 
 		 302 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  37.21 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  34.8 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  44.71 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  37.29 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  37.33 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  39.07 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  36.21 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  39.91 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  38.08 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  37.76 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  39.91 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  35.47 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  36.77 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  43.52 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  38.65 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  35.25 
 
 		 306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  38.57 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  38.57 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  43.15 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  35.76 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  38.26 
 
 		 302 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  34.33 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  39.3 
 
 		 289 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  32.52 
 
 		 295 aa  115  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  38.51 
 
 		 339 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  35.6 
 
 		 348 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  35.47 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  35.04 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  34.33 
 
 		 314 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  32.99 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  32.88 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  36.03 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  35.23 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  35.05 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>