More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0989 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  100 
 
 
300 aa  580  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  44.48 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1997  UspA domain-containing protein  34.63 
 
 
386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  35.31 
 
 
293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.19 
 
 
284 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  35.14 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  33.9 
 
 
293 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  36.33 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  35.52 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  36.67 
 
 
291 aa  109  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.56 
 
 
288 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  35.02 
 
 
293 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  37.5 
 
 
287 aa  108  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  32.76 
 
 
295 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  32.76 
 
 
295 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  32.76 
 
 
295 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  34.13 
 
 
277 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.37 
 
 
288 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  31.63 
 
 
294 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  31.63 
 
 
294 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  34.35 
 
 
288 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 
293 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
288 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 
297 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  31.42 
 
 
294 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  33.44 
 
 
289 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  33.86 
 
 
297 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  33.33 
 
 
288 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  34.25 
 
 
285 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  33.77 
 
 
298 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
298 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
298 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  31.12 
 
 
341 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  33.01 
 
 
295 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  30.77 
 
 
341 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
289 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
341 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  32.18 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  33.55 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  32.78 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
289 aa  96.3  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  32.08 
 
 
287 aa  96.3  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  34.47 
 
 
277 aa  96.3  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  32.2 
 
 
292 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  32.2 
 
 
292 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  33.33 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  32.55 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  31.86 
 
 
292 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.34 
 
 
299 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  38.02 
 
 
291 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  32.15 
 
 
294 aa  94  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  32.52 
 
 
295 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
298 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
289 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  31.83 
 
 
277 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
293 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  32.07 
 
 
293 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  32.07 
 
 
293 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  34.36 
 
 
277 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  31.99 
 
 
295 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  30.26 
 
 
341 aa  90.5  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
294 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  27.96 
 
 
345 aa  89.7  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  32 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  30.62 
 
 
297 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  32.89 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  33.67 
 
 
299 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  33.44 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05020  universal stress protein UspA-like protein  34.68 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  33.44 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  31.08 
 
 
300 aa  86.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  40.24 
 
 
322 aa  86.3  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  30.65 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 
293 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  33.44 
 
 
324 aa  84  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  39.24 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  40.82 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  33.56 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  40.76 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  34.69 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  31.82 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  28.03 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  31.23 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  32.54 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  32.67 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  39.87 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  34.08 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  43.15 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  32 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  30.23 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  39.04 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  31.79 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 
297 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  30.98 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  33.56 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>