More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1742 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  286  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  53.02 
 
 		 151 aa  139  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  47.97 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  49.28 
 
 		 339 aa  103  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  46.04 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  46.72 
 
 		 303 aa  101  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  47.37 
 
 		 155 aa  100  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  48.23 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  42.42 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  42.42 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  43.75 
 
 		 284 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  44.76 
 
 		 288 aa  90.5  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  42.36 
 
 		 321 aa  90.1  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 		 296 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  43.75 
 
 		 292 aa  89.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  40.71 
 
 		 293 aa  88.6  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  41.26 
 
 		 289 aa  88.6  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  40.43 
 
 		 294 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 		 294 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 		 294 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  40.6 
 
 		 289 aa  86.7  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  43.97 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  41.18 
 
 		 305 aa  86.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  42.25 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  40 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  38.52 
 
 		 308 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  46.26 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  40.29 
 
 		 164 aa  84.3  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  40.6 
 
 		 288 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  40.15 
 
 		 290 aa  83.6  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  39.72 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  41.79 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  41.3 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  41.61 
 
 		 307 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  38.52 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  39.71 
 
 		 310 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  31.62 
 
 		 341 aa  81.3  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  39.55 
 
 		 302 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 293 aa  81.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.52 
 
 		 288 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  37.41 
 
 		 293 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  36.69 
 
 		 289 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 293 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  39.26 
 
 		 343 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  37.76 
 
 		 306 aa  80.1  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  40.71 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  40.58 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  38.24 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  39.04 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  39.57 
 
 		 291 aa  78.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  40.15 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  39.42 
 
 		 296 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  38.73 
 
 		 291 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  38.52 
 
 		 294 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  42.25 
 
 		 289 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  36.76 
 
 		 305 aa  78.2  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  39.26 
 
 		 305 aa  77.8  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  37.31 
 
 		 287 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  37.31 
 
 		 277 aa  77.4  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  37.68 
 
 		 282 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  38.81 
 
 		 294 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  38.81 
 
 		 294 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  40.15 
 
 		 293 aa  77  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 294 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 293 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 298 aa  77  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  38.41 
 
 		 192 aa  76.6  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  39.58 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  31.62 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  35.57 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  40 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  34.48 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  38.52 
 
 		 348 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  39.01 
 
 		 313 aa  74.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  36.96 
 
 		 317 aa  74.7  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 293 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  38.41 
 
 		 294 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 		 292 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  37.13 
 
 		 381 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 		 296 aa  73.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 295 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  41.55 
 
 		 301 aa  73.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  40.52 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  39.71 
 
 		 373 aa  73.6  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 		 297 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 293 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 296 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  38.03 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  36.03 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  37.32 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  37.5 
 
 		 295 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2137  UspA domain-containing protein  46.21 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.221576  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  35.56 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 295 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 295 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>