More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1114 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  100 
 
 
294 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  99.32 
 
 
294 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  56.51 
 
 
294 aa  325  7e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  58.7 
 
 
295 aa  309  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  53.56 
 
 
293 aa  287  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  52.04 
 
 
293 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  55.99 
 
 
298 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  55.99 
 
 
298 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  55.99 
 
 
298 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  52.04 
 
 
295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  49.49 
 
 
297 aa  255  5e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  53.22 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  50.68 
 
 
295 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  50.68 
 
 
295 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  50.68 
 
 
295 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  48.15 
 
 
341 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  47.81 
 
 
341 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  47.81 
 
 
341 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  51.04 
 
 
297 aa  241  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  53.38 
 
 
294 aa  229  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  48.31 
 
 
292 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  48.31 
 
 
292 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  48.31 
 
 
292 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  48.79 
 
 
293 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  48.79 
 
 
293 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  48.79 
 
 
293 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  47.35 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  47.47 
 
 
294 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  47.14 
 
 
294 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  47.14 
 
 
294 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  46.6 
 
 
317 aa  215  8e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  45.23 
 
 
293 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  48.95 
 
 
296 aa  201  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  44.95 
 
 
275 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  42.67 
 
 
275 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  40.61 
 
 
293 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  40.89 
 
 
347 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  40 
 
 
293 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  47.47 
 
 
373 aa  149  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  36.91 
 
 
305 aa  143  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  35.22 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  38.96 
 
 
321 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  38.87 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.67 
 
 
299 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  49 
 
 
393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  38.75 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  36.51 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  34.93 
 
 
292 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  43.66 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.74 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  36.08 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  40 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  34.11 
 
 
296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  38.78 
 
 
304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
290 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  35.05 
 
 
289 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  33.91 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  38.7 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
288 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
298 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  38.54 
 
 
323 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.06 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 
291 aa  125  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  40.48 
 
 
288 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  38.11 
 
 
274 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  34.36 
 
 
288 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  37 
 
 
308 aa  123  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  38.97 
 
 
288 aa  122  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  40.2 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  34.14 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  34.98 
 
 
277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  33.1 
 
 
298 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
298 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  33.92 
 
 
289 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  36.61 
 
 
339 aa  118  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  35.28 
 
 
317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
381 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  34.02 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  38.44 
 
 
296 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  37.5 
 
 
301 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  36.75 
 
 
300 aa  112  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  38.49 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  35.02 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  34.8 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  32.75 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  33.11 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  35.07 
 
 
287 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  32.29 
 
 
287 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  32.75 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  35.71 
 
 
294 aa  109  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  33.56 
 
 
300 aa  109  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  41.12 
 
 
276 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  34.83 
 
 
282 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4449  hypothetical protein  33.33 
 
 
311 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  31.83 
 
 
301 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  45.05 
 
 
315 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  35.47 
 
 
303 aa  107  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>