More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1119 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  100 
 
 
292 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  99.66 
 
 
292 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  60.21 
 
 
297 aa  332  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  57.8 
 
 
293 aa  291  7e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  51.06 
 
 
295 aa  253  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  48.12 
 
 
297 aa  240  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  52.04 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  48.99 
 
 
294 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  48.31 
 
 
294 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  48.31 
 
 
294 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  47.96 
 
 
295 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  47.96 
 
 
295 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  47.96 
 
 
295 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  49.49 
 
 
294 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  49.49 
 
 
294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  49.15 
 
 
294 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  49.15 
 
 
294 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  45.45 
 
 
295 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  45.89 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  44.18 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  45.27 
 
 
293 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  47 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  47 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  47 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  47.37 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  46.13 
 
 
341 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  45.49 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  45.79 
 
 
341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  45.49 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  45.79 
 
 
341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  45.14 
 
 
293 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  44.63 
 
 
275 aa  175  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  40.26 
 
 
317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
296 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  39.14 
 
 
293 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  39.32 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  39.8 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.18 
 
 
288 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  40.77 
 
 
299 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  36.71 
 
 
289 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  36.9 
 
 
288 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  39.53 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  40.85 
 
 
277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  39.61 
 
 
321 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.58 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  36.55 
 
 
347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  38.89 
 
 
303 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
296 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  34.54 
 
 
317 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  34.83 
 
 
292 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  37.88 
 
 
291 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  36.93 
 
 
298 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  35.55 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  37.41 
 
 
282 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  39.62 
 
 
300 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  37.25 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  35.59 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  36.95 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  37.81 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  38.44 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  35.93 
 
 
290 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  36.33 
 
 
308 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  40.2 
 
 
315 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  37.54 
 
 
283 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.08 
 
 
288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  35.74 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  33.1 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  37.04 
 
 
373 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  31.48 
 
 
290 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  38.1 
 
 
285 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  38.49 
 
 
288 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  38.98 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  34.23 
 
 
291 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  34.59 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  38.33 
 
 
310 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  36.42 
 
 
302 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  35.52 
 
 
304 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  32.8 
 
 
306 aa  108  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  37.67 
 
 
301 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  31.99 
 
 
341 aa  107  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  37.41 
 
 
339 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  34.13 
 
 
296 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 
277 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  32.53 
 
 
345 aa  105  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  32.18 
 
 
301 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  36.55 
 
 
303 aa  103  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  37.78 
 
 
293 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  38.93 
 
 
393 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  31.27 
 
 
289 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  32.76 
 
 
290 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  41.78 
 
 
324 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  36.03 
 
 
308 aa  99.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  33.8 
 
 
292 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  36.09 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  35.99 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>