More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06810 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 
322 aa  633  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30980  universal stress protein UspA-like protein  44.08 
 
 
334 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.34325  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  36.39 
 
 
343 aa  149  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  39.33 
 
 
324 aa  140  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  37.5 
 
 
348 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  37.72 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  36.82 
 
 
310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  36.08 
 
 
292 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  35.81 
 
 
308 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
292 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  35.47 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  35.47 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  36.27 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  37.17 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  34.1 
 
 
317 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  35.69 
 
 
277 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  33.33 
 
 
341 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
341 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  34.32 
 
 
305 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  34.58 
 
 
295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.54 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.58 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  33.68 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  34.77 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  36.24 
 
 
288 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  30.33 
 
 
345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
293 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  34.67 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  32.65 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  31.42 
 
 
341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 
296 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  38.05 
 
 
275 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
293 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
289 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  35.92 
 
 
317 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
288 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
295 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  30.87 
 
 
295 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  35.31 
 
 
303 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
295 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
293 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  31.53 
 
 
297 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  35.35 
 
 
277 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
293 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.59 
 
 
284 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  33.1 
 
 
305 aa  99.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  36.21 
 
 
287 aa  99.8  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
296 aa  99.8  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  36.64 
 
 
293 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  30.95 
 
 
297 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  33.66 
 
 
302 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
295 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  34.6 
 
 
294 aa  96.7  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 
289 aa  96.3  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  34.12 
 
 
294 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  33.78 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  35.86 
 
 
321 aa  92.8  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  31.46 
 
 
293 aa  92.8  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  30.42 
 
 
303 aa  92.8  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  33.88 
 
 
307 aa  92.4  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  33.68 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  32.67 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  31.48 
 
 
298 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
296 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  33.67 
 
 
305 aa  89.7  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
276 aa  89.7  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  33.11 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  29.8 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  35 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  35.47 
 
 
296 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  35.35 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  32.11 
 
 
289 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.95 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  31.1 
 
 
291 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  34.23 
 
 
339 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  40.24 
 
 
300 aa  86.3  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  33.55 
 
 
300 aa  86.3  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  32.12 
 
 
308 aa  86.3  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  32.29 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  32.52 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  30.79 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  33.45 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  32.45 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  32.56 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  28.62 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  30.98 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  33.44 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  32.77 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  34.41 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  30.27 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>