More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2802 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2802  UspA domain protein  100 
 
 		 174 aa  345  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1014  UspA domain protein  47.66 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  44.6 
 
 		 293 aa  99.4  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  46.81 
 
 		 147 aa  96.3  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  42.34 
 
 		 143 aa  93.6  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  43.36 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  43.97 
 
 		 289 aa  89.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  43.17 
 
 		 288 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  41.5 
 
 		 155 aa  84.7  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  41.84 
 
 		 339 aa  84.3  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  42.55 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  41.5 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  38.57 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  40.28 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  35.77 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  44.06 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  38.19 
 
 		 289 aa  78.6  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  39.02 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  40 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  37.5 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  39.19 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  39.31 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.84 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  35.46 
 
 		 306 aa  74.3  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  37.01 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.99 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  39.72 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4449  hypothetical protein  44.6 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  35.97 
 
 		 321 aa  71.6  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  34.19 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  39.72 
 
 		 293 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  36.43 
 
 		 317 aa  71.2  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 		 343 aa  71.2  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.87 
 
 		 284 aa  71.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.11 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.87 
 
 		 288 aa  70.9  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  36.43 
 
 		 305 aa  70.9  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  41.01 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  40.14 
 
 		 288 aa  70.9  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  34.19 
 
 		 297 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  31.33 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.25 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  36.81 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  39.01 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  39.29 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  33.95 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  37.74 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  38.13 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  40.71 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  39.6 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  37.68 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  35.51 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  35.66 
 
 		 308 aa  68.6  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  38.46 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  37.16 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  38.67 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  37.75 
 
 		 287 aa  68.6  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 		 289 aa  68.2  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.6 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 276 aa  67.8  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  33.56 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30.28 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.55 
 
 		 288 aa  67.4  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  41.91 
 
 		 305 aa  67  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 291 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 277 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 296 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1534  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  35.77 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  37.06 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  36.13 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  33.56 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  37.41 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  34.16 
 
 		 305 aa  65.1  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  35.42 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 294 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  35.86 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  32.64 
 
 		 294 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  37.96 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 		 289 aa  64.7  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 294 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  36 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 293 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  35.66 
 
 		 293 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 293 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>