More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1870 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  285  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  42.42 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  39.16 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  40.94 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05020  universal stress protein UspA-like protein  41.04 
 
 		 293 aa  78.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  42.45 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  39.01 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  41.89 
 
 		 292 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  42.57 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 		 188 aa  73.9  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  38.85 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  36.5 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.41 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.24 
 
 		 299 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  41.01 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  37.68 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  42.86 
 
 		 274 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  33.09 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.68 
 
 		 284 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.33 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  40.29 
 
 		 303 aa  70.9  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  40.74 
 
 		 291 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 		 293 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  37.93 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.3 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  39.1 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  35.46 
 
 		 289 aa  68.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 294 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  31.76 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  34.97 
 
 		 317 aa  68.2  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.17 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  38.36 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  37.24 
 
 		 294 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 294 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  37.59 
 
 		 288 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.22 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  38.24 
 
 		 301 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  38.71 
 
 		 313 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  34.48 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.9 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  39.86 
 
 		 321 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18580  universal stress protein UspA-like protein  39.16 
 
 		 272 aa  67.4  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3797  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  37.14 
 
 		 339 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  36.43 
 
 		 373 aa  67  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  33.77 
 
 		 192 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.62 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  36.91 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  39.39 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  30.22 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  36.03 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.41 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  33.09 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.78 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  38.69 
 
 		 296 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  37.23 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  36.99 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  37.06 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 289 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  33.79 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  34.27 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  36.99 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4576  UspA domain-containing protein  44.33 
 
 		 276 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.66 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 297 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  35.57 
 
 		 303 aa  63.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.56 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  32.28 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  37.96 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  36.17 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  32.64 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  42.03 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.91 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  37.24 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  47.44 
 
 		 280 aa  62  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  37.04 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  34.56 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  35.81 
 
 		 283 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 293 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 		 293 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0949  UspA domain protein  43.45 
 
 		 331 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132652  normal  0.0181278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  42.66 
 
 		 298 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  34.01 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>