232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4576 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4576  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  29.02 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  29.86 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  32.42 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  30.93 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  32.18 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  30.21 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  30 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  28.81 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  30.88 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  29.72 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  30.8 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  30.18 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  31.11 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  30.03 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  31.96 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  29.02 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  29.87 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  32.03 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  31.94 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  28.62 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.58 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  29.7 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  39.42 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  28.62 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  42.48 
 
 		 147 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  30.66 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  29.23 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  29.93 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  28.77 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1869  UspA domain-containing protein  46.85 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1638  UspA domain protein  38.13 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170116  normal  0.0161914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  30.69 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  29.23 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  34.31 
 
 		 144 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  29.62 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  29.77 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  29.35 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  27.61 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  30.61 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  28.42 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.74 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  30.77 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  32.42 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  33.15 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.78 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  33.79 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  28.23 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  36.23 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  27.8 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  30.39 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  26.21 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  28.32 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  31.69 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  33.17 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  30 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  32.39 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  28.42 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  29.77 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  34.91 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  33.83 
 
 		 147 aa  58.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  36.64 
 
 		 144 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3300  UspA domain protein  37.3 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176121  normal  0.0128083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1798  UspA domain protein  34.56 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.104152  normal  0.0257832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  31.32 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  37.14 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  25 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  28.82 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  27.49 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  29.64 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  30.34 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22870  universal stress protein UspA-like protein  32.62 
 
 		 149 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.354321 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  35.61 
 
 		 183 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  28.87 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  34.27 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>