More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2614 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  100 
 
 		 280 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  45.65 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  40.07 
 
 		 282 aa  162  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  36.1 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  32.17 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30.92 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  30.1 
 
 		 300 aa  95.9  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  37.56 
 
 		 415 aa  94.7  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  31.19 
 
 		 324 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2471  UspA domain protein  29.41 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584159  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  39.57 
 
 		 145 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  30.24 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  45.71 
 
 		 151 aa  86.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  33.56 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  31.12 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.74 
 
 		 290 aa  85.9  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  38.69 
 
 		 149 aa  85.9  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  38.03 
 
 		 148 aa  85.9  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  34.15 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  23.57 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  44.52 
 
 		 152 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  38.13 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  31.91 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  26.24 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.41 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  37.59 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35.25 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  30.21 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  27.34 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  26.07 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  29.83 
 
 		 297 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  30.04 
 
 		 289 aa  82  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  31.09 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  36.69 
 
 		 145 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  31.96 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  32.99 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  34.83 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  31.72 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  32.03 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  37.24 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  39.26 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  33.33 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  38.03 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  30.94 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  25.45 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  36.09 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  32.28 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  29 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  34.78 
 
 		 147 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32.19 
 
 		 157 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  30.14 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  30.07 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.57 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.97 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  38.57 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 144 aa  77  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  23.81 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  38.62 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  27.69 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  25.82 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  28.17 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  35.04 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  26.09 
 
 		 297 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 148 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  35.25 
 
 		 141 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 167 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.68 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.04 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  35.64 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  26.79 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  31.07 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  30.87 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  25.41 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  37.23 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  26.44 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.33 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  37.68 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  35.51 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  35.29 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  23.84 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  31.1 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  35.77 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  38.13 
 
 		 143 aa  72  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  30.63 
 
 		 283 aa  72  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  35.66 
 
 		 159 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.21 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0913  UspA domain-containing protein  41.18 
 
 		 138 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  35.21 
 
 		 150 aa  72  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  28.63 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  29.44 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5604  UspA domain protein  31.92 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.945797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 		 138 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  33.8 
 
 		 151 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>