More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0290 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  100 
 
 		 159 aa  308  2.9999999999999997e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  40 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  42.25 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  44.37 
 
 		 303 aa  85.9  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 293 aa  81.3  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  38.73 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 		 288 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  41.73 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  39.72 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  38.13 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  40.85 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  43.48 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  37.04 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  36.69 
 
 		 347 aa  75.1  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.93 
 
 		 299 aa  75.1  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  41.43 
 
 		 288 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 275 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  38.03 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  36.5 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  40.71 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  39.42 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  36.09 
 
 		 289 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.33 
 
 		 288 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  38.69 
 
 		 297 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 295 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  38.46 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  41.06 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  37.5 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  36.5 
 
 		 341 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  37.93 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 341 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 287 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 294 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  41.55 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  36.76 
 
 		 305 aa  67.8  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  36.96 
 
 		 296 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  40.58 
 
 		 323 aa  67.4  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  36.62 
 
 		 294 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  35.77 
 
 		 297 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 294 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 		 297 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  39.13 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  34.25 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  34.31 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  37.41 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  36.69 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  34.31 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  34.31 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  39.29 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  35.51 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  33.56 
 
 		 294 aa  64.7  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  36.88 
 
 		 301 aa  64.7  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 300 aa  64.7  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  39.39 
 
 		 295 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  37.59 
 
 		 324 aa  64.7  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 		 293 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0344  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 284 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  37.84 
 
 		 305 aa  63.9  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  36.69 
 
 		 283 aa  63.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  36.11 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  35.97 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  33.33 
 
 		 301 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  37.68 
 
 		 393 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  35.93 
 
 		 381 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4449  hypothetical protein  36.23 
 
 		 311 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  35.04 
 
 		 295 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  40.71 
 
 		 285 aa  61.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1798  UspA domain protein  38.69 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.104152  normal  0.0257832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  37.66 
 
 		 302 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  33.1 
 
 		 287 aa  60.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  36.11 
 
 		 277 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  35.42 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  33.33 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  35.25 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  36.67 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  40.29 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  30.56 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>