More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2082 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  100 
 
 
170 aa  337  5e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  53.02 
 
 
159 aa  148  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  39.07 
 
 
155 aa  87.4  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  37.84 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 
289 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2072  UspA domain protein  38.93 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000584159 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  38.24 
 
 
322 aa  72  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  34.36 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 
294 aa  71.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  40 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  31.69 
 
 
341 aa  68.9  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  34.78 
 
 
294 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  35.48 
 
 
292 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 
294 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 
292 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  38.24 
 
 
303 aa  68.6  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 
294 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 
292 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2137  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.221576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.46 
 
 
288 aa  67.4  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
300 aa  67  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  35.4 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  34.81 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.9 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  35 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.75 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  35.51 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  36 
 
 
293 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  36 
 
 
293 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  36 
 
 
293 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  37.58 
 
 
288 aa  64.7  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  31.79 
 
 
294 aa  63.9  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  33.8 
 
 
339 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  35.62 
 
 
324 aa  63.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
343 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  37.5 
 
 
306 aa  63.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  32.32 
 
 
347 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  33.54 
 
 
294 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
277 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  33.54 
 
 
294 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
341 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  31.76 
 
 
341 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
341 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  36.55 
 
 
305 aa  62  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 
188 aa  62  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  34.31 
 
 
317 aa  62  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.22 
 
 
153 aa  61.6  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  35.86 
 
 
305 aa  61.6  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  34.48 
 
 
310 aa  61.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  30.28 
 
 
150 aa  61.2  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  30.71 
 
 
289 aa  61.2  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  27.66 
 
 
345 aa  60.8  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  33.54 
 
 
294 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  35.76 
 
 
296 aa  60.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  34.01 
 
 
192 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  34.25 
 
 
321 aa  59.3  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2071  UspA domain protein  38.69 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000068593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  38.85 
 
 
313 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  35.25 
 
 
308 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  34.75 
 
 
321 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5215  UspA domain protein  40.51 
 
 
284 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
295 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  35.77 
 
 
164 aa  57.8  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  36.05 
 
 
307 aa  57.4  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  35.21 
 
 
144 aa  57.4  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  35.54 
 
 
373 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  30 
 
 
296 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  36 
 
 
289 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  30.28 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  33.57 
 
 
294 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  30.71 
 
 
287 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  31.69 
 
 
348 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  35.51 
 
 
305 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
289 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  33.54 
 
 
293 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  34.23 
 
 
288 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
293 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  37.96 
 
 
147 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
293 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  32.86 
 
 
169 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
288 aa  55.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  32.54 
 
 
381 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  33.79 
 
 
308 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0988  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 
304 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 
296 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
287 aa  55.1  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 
153 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
293 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  29.8 
 
 
295 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  30.5 
 
 
287 aa  54.7  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  30.87 
 
 
301 aa  54.7  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2049  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
289 aa  54.7  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  32.62 
 
 
170 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  33.12 
 
 
297 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  32.62 
 
 
170 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
277 aa  54.3  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  32.89 
 
 
155 aa  54.3  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>