297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5215 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5215  UspA domain protein  100 
 
 
284 aa  557  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  37.89 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  36.95 
 
 
289 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.17 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  34.59 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  34.74 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  35.62 
 
 
292 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.92 
 
 
288 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.76 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  37.46 
 
 
289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  35.54 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  33.45 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  33.9 
 
 
289 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  36.95 
 
 
291 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  35.64 
 
 
287 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.29 
 
 
299 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  31.4 
 
 
293 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  31.82 
 
 
282 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  33.33 
 
 
315 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  35.99 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  33.9 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  33.79 
 
 
281 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  35.92 
 
 
285 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  33.62 
 
 
293 aa  95.5  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  30.38 
 
 
295 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  32.28 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  30.38 
 
 
295 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  33.45 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  30.38 
 
 
295 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  35.52 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  32.76 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  31.38 
 
 
289 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  31.27 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  31.27 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
294 aa  89.4  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
290 aa  89  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  40.22 
 
 
289 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  33.33 
 
 
294 aa  87  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  31.51 
 
 
303 aa  86.7  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  32.57 
 
 
297 aa  85.5  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  33.92 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  32.76 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  31.53 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  30.57 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  31.53 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  31.53 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  31.74 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
277 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  30.38 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  30.24 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  29.41 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  29.35 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  30.03 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  30.3 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  30.03 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  30.07 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  29.97 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  29.97 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  33.1 
 
 
373 aa  79  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  30.33 
 
 
293 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  30.33 
 
 
293 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  30 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  30.17 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  32.46 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  30.94 
 
 
308 aa  77  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  29.35 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  31.53 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  32.07 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  29.59 
 
 
297 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  32.95 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  32.87 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  32.55 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  32.63 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  29.83 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  28.08 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  29.77 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  32.35 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  27.7 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  31.1 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3041  putative stress-inducible protein  34.71 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.921902  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  28.86 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  37.5 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  35.48 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  30.77 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  29.54 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  29.9 
 
 
276 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  31.68 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  28.95 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>