More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2634 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  100 
 
 
170 aa  335  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  100 
 
 
170 aa  335  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  98.82 
 
 
169 aa  327  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  44.14 
 
 
151 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  41.38 
 
 
153 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  35.86 
 
 
153 aa  97.4  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  41.38 
 
 
153 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  41.38 
 
 
153 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  40.54 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  36.99 
 
 
152 aa  95.5  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  39.46 
 
 
150 aa  95.1  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  35.62 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  40.41 
 
 
304 aa  91.3  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 
162 aa  91.3  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  37.93 
 
 
156 aa  89  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  34.48 
 
 
153 aa  88.6  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  39.16 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  40.28 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.48 
 
 
151 aa  85.9  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  40.28 
 
 
141 aa  84.3  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  34.67 
 
 
154 aa  84.7  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  32.24 
 
 
149 aa  84.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
153 aa  84.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  36.42 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  36.55 
 
 
159 aa  84  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  38.93 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  36.67 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  34.9 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  32.43 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  33.55 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  31.65 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  35.06 
 
 
212 aa  81.3  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  38.62 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  34.67 
 
 
289 aa  81.3  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  37.93 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30.13 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  33.77 
 
 
149 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.33 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  37.67 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  40.13 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  33.56 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.76 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  39.33 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.65 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  31.01 
 
 
147 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  36.11 
 
 
148 aa  79  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  38.51 
 
 
157 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  35.86 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  35.44 
 
 
146 aa  79  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  34.97 
 
 
142 aa  79  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
151 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40.28 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  37.25 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  37.16 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  36.73 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  39.72 
 
 
162 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  36.55 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  36.88 
 
 
290 aa  77  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  31.52 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  36.94 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  34.19 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  36.77 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  35.66 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  35.95 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  37.18 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  35.86 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34.3 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  37.5 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  37.09 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  37.5 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  34.01 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.72 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  39.86 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
297 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  34.93 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  30.41 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  36.31 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  35.86 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  34.69 
 
 
311 aa  74.7  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  35.95 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  35.67 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  31.71 
 
 
310 aa  74.3  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  35.85 
 
 
415 aa  74.3  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3093  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  37.33 
 
 
291 aa  73.9  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  37.58 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  37.58 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>