More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3647 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  100 
 
 
183 aa  352  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  47.48 
 
 
144 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  45.27 
 
 
155 aa  101  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  48.53 
 
 
143 aa  99.8  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  45 
 
 
144 aa  88.2  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 
164 aa  85.5  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  45.99 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  45.19 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  42.25 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  42.45 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  38.3 
 
 
317 aa  78.6  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  41.73 
 
 
284 aa  78.2  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  41.96 
 
 
305 aa  77.8  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  36.42 
 
 
341 aa  77  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  42.86 
 
 
285 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2071  UspA domain protein  46.04 
 
 
152 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000068593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2072  UspA domain protein  42.86 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000584159 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  37.11 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  35.21 
 
 
345 aa  74.3  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  42.86 
 
 
192 aa  74.3  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22870  universal stress protein UspA-like protein  41.26 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.354321 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  42.96 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  40.82 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  40.97 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  39.6 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  40.71 
 
 
293 aa  71.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  42.03 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  38.69 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.16 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  35.56 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  40.44 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  41.3 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  37.23 
 
 
299 aa  68.6  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2137  UspA domain-containing protein  40.71 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.221576  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  38.26 
 
 
310 aa  68.2  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  39.61 
 
 
292 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  39.61 
 
 
292 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  39.61 
 
 
292 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.24 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0344  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  38.96 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  42.75 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  39.86 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.22 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  35.67 
 
 
321 aa  64.7  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  38.13 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 
277 aa  64.3  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.38 
 
 
170 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
289 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  38.85 
 
 
288 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  39.86 
 
 
293 aa  63.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.38 
 
 
170 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 
295 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 
147 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 
294 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  38.62 
 
 
140 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  35.86 
 
 
147 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 
289 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  37.65 
 
 
313 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  41.84 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  36.81 
 
 
148 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  42.95 
 
 
298 aa  62.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  35.53 
 
 
277 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  37.5 
 
 
273 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1902  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 
166 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156681  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  34.78 
 
 
288 aa  62.4  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  33.53 
 
 
308 aa  62.4  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  35.1 
 
 
291 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  36.91 
 
 
305 aa  62  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  34.81 
 
 
294 aa  62  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 
277 aa  62  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
290 aa  61.6  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
287 aa  61.2  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  43.57 
 
 
289 aa  61.2  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  38.69 
 
 
289 aa  61.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  33.33 
 
 
306 aa  61.2  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  38.41 
 
 
283 aa  60.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  36.3 
 
 
324 aa  61.2  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  42.57 
 
 
296 aa  60.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  36.67 
 
 
348 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  35.95 
 
 
302 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  38.13 
 
 
139 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 
138 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  36.25 
 
 
373 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2076  UspA domain protein  35.04 
 
 
288 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000523468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  37.04 
 
 
294 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 
300 aa  59.7  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  36.43 
 
 
140 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  37.04 
 
 
294 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  37.04 
 
 
294 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  30.82 
 
 
168 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  36.25 
 
 
300 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  37.86 
 
 
287 aa  59.3  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
297 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
293 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  32.58 
 
 
381 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>