83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0988 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0988  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 304 aa  579  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1000  UspA domain-containing protein  34.24 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172232  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1005  UspA domain-containing protein  36.1 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.137418  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0996  UspA domain-containing protein  35.91 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  30.57 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  30.9 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0997  UspA domain-containing protein  32.54 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975908  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  30.18 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  30.87 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  33.9 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  28.47 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  29.47 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  32.29 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  29.97 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  30.69 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  27.01 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  31.67 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  31.3 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  31.27 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  30.5 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  29.25 
 
 		 170 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  30.92 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  30.51 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  29.12 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  32.17 
 
 		 144 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.79 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  31.16 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  32.31 
 
 		 277 aa  52.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  29.44 
 
 		 294 aa  52.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  29.54 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  28.92 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  35.17 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  26.8 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  32.7 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  28.81 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  27.78 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  30.22 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  28.79 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  27.92 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1534  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  29.3 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.64 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  29.38 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  31.88 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  33.79 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  35.56 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  30.59 
 
 		 291 aa  46.2  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  26.34 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  31.56 
 
 		 298 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  27.7 
 
 		 373 aa  45.8  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  31.83 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  29.13 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  28.37 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  30 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  29.13 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0660  UspA domain protein  33.66 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  28.53 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  29.13 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  28.52 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  29 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 151 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  27.67 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  30.9 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  30.95 
 
 		 154 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2137  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 147 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.221576  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  31.55 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  29.23 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2072  UspA domain protein  31.76 
 
 		 149 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000584159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  31.76 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  31.17 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0192  UspA domain protein  34.57 
 
 		 288 aa  43.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  27.76 
 
 		 295 aa  42.7  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  33.33 
 
 		 183 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  26.21 
 
 		 294 aa  42.4  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>