More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3034 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  39.25 
 
 		 289 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  40.26 
 
 		 296 aa  123  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  38.33 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  38.33 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  38.33 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 289 aa  122  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  33.64 
 
 		 301 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  33.44 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.91 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  31.92 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  32.92 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.71 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  35.9 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  34.1 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  34.1 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  32.89 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  33.89 
 
 		 293 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  32.42 
 
 		 290 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  35.84 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  39.86 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  34.03 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  35.43 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  37.15 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  31.44 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  32.31 
 
 		 341 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  32.31 
 
 		 341 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  36.77 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  36.33 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  36.75 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  35 
 
 		 288 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  30.65 
 
 		 317 aa  99.4  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  35.23 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  30.67 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  35.07 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  36.54 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  33.77 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  35.08 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  33.66 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  34.11 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  33.96 
 
 		 296 aa  95.9  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  35.91 
 
 		 291 aa  95.9  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  36.22 
 
 		 292 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  36.22 
 
 		 292 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  35.5 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  30.59 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  36.48 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  32.34 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  35.53 
 
 		 294 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 294 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  33.9 
 
 		 294 aa  92.4  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  33.23 
 
 		 317 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  31.77 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  37.74 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  31.88 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 343 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  35.96 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  34.84 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.45 
 
 		 284 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  34.34 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  31.39 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  31.39 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  32.34 
 
 		 297 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  33 
 
 		 277 aa  85.9  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  32.54 
 
 		 300 aa  85.5  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  31.39 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  32.72 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  34.67 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  35.35 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  34.8 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  31.23 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5215  UspA domain protein  33.47 
 
 		 284 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  33.12 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  32.89 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  31.63 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  35.52 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  32.57 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  31.35 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  35.69 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  33.56 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  34.21 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  33 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  32.89 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  26.07 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  29.97 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  32.12 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>