199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0997 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0997  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  597  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975908  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.1 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  34.56 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  33.79 
 
 		 288 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1005  UspA domain-containing protein  34.47 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.137418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  34.26 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  31.88 
 
 		 287 aa  99.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  31.47 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  31.44 
 
 		 291 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  30.07 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  33.89 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  34.26 
 
 		 277 aa  96.3  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 		 293 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  32 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0996  UspA domain-containing protein  35.05 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 289 aa  92.4  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  32.07 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.02 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.91 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  31.71 
 
 		 393 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  32.52 
 
 		 288 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  32.06 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.88 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  29.07 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  29.82 
 
 		 305 aa  85.9  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  31.19 
 
 		 290 aa  85.9  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  32.16 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  30.24 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0988  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  30.54 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  30.54 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  30.54 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  29.76 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  29.76 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  31 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  29.76 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  30.41 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  30.51 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  30.51 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1000  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172232  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  28.81 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  30.91 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  27.7 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  27.3 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  27.3 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  27.3 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  31.12 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  28.76 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  31.98 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  30.93 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  29.63 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  27.99 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  30.98 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  29.57 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  28.91 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  29.05 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  30.04 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  28.96 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  29.62 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  30.74 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  29.9 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  30.69 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  27.56 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  32.44 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  28.52 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  26.48 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  29.97 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  30.42 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  34.53 
 
 		 147 aa  65.1  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  30.39 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  32.19 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  31.72 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  30.93 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  28.03 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  26.37 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  30.93 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  25.84 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2049  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  29.84 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  26.69 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  29.73 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  28.57 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  26.47 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  26.55 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4144  UspA domain protein  28.8 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>