109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0996 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0996  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 296 aa  565  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1005  UspA domain-containing protein  49.31 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.137418  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0997  UspA domain-containing protein  35.05 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975908  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0988  UspA domain-containing protein  35.52 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1000  UspA domain-containing protein  35.54 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172232  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  32.97 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  32.75 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  31.8 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  31.95 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  34.53 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  33.33 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  31.14 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  31.14 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  30.7 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  30.11 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  29.33 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  30.85 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  27.97 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  34.93 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  32.49 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  33.19 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  33.18 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  36.36 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  28.82 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  34.33 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  31.21 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  32.49 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.69 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.75 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  28.47 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  27.71 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  31.09 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  28.14 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  30.5 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  32.71 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  29.27 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  30.71 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  32.38 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  28.47 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  29.96 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  24.75 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  33.48 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  31.96 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  28.11 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  29.76 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  31.28 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  29.33 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  30.77 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  30.42 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  28.62 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  32.38 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  35.71 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  29.43 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  29.43 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  27.4 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1382  UspA domain-containing protein  26.61 
 
 		 280 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.670048  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1534  UspA domain-containing protein  31.7 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  33.83 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  32.38 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  28.42 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  33.54 
 
 		 305 aa  49.3  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  30.22 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  30.87 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  30.32 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  29.7 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  29.69 
 
 		 341 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  32.49 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  33.14 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  32.89 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  29.17 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  31.2 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 188 aa  46.6  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  31.84 
 
 		 275 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  28.22 
 
 		 289 aa  46.2  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  30.77 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 144 aa  45.8  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  26.79 
 
 		 281 aa  45.8  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  30.17 
 
 		 298 aa  45.8  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  27.03 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  27.03 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  27.03 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1072  hypothetical protein  29.02 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1088  UspA domain-containing protein  29.02 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103411  normal  0.107054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.6 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  44.64 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>