241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1088 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1072  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1088  UspA domain-containing protein  100 
 
 
295 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103411  normal  0.107054 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  46.78 
 
 
298 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  46.78 
 
 
298 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  46.44 
 
 
298 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  35.27 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.83 
 
 
299 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
297 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
295 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  34.58 
 
 
347 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  35.05 
 
 
297 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  34.97 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  34.6 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  34.6 
 
 
294 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  34.6 
 
 
294 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 
293 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  34.26 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  33.91 
 
 
295 aa  119  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
293 aa  119  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  36.21 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  33.56 
 
 
303 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  35.27 
 
 
294 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  31.86 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  31.89 
 
 
293 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  38.19 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  32.87 
 
 
295 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  30.74 
 
 
341 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
295 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  30.74 
 
 
341 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
295 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  31.27 
 
 
341 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  34.13 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  34.47 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  34.35 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  33.33 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  34.24 
 
 
285 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.09 
 
 
288 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  34.15 
 
 
292 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  31.96 
 
 
289 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
295 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  30.17 
 
 
296 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  32.29 
 
 
293 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  33.01 
 
 
294 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  36.96 
 
 
373 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  34.17 
 
 
294 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  32.53 
 
 
290 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  34.17 
 
 
294 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
297 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  34.17 
 
 
294 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 
296 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  33.89 
 
 
289 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
275 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  32.75 
 
 
296 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.94 
 
 
284 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  32.54 
 
 
298 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  32.54 
 
 
298 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  32.54 
 
 
298 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  32.76 
 
 
287 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  32.65 
 
 
315 aa  99.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
277 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  31.86 
 
 
289 aa  99.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  33.78 
 
 
277 aa  99.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  33.11 
 
 
290 aa  99.4  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  31.76 
 
 
288 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.45 
 
 
288 aa  99  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  30.67 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  35.75 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  30.8 
 
 
290 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
295 aa  97.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
275 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  39.27 
 
 
393 aa  96.3  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  30.93 
 
 
288 aa  95.9  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  34.13 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  36.04 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  31.93 
 
 
309 aa  93.6  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  32.43 
 
 
292 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
292 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  32.42 
 
 
308 aa  93.2  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  31.65 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  32.76 
 
 
281 aa  92.4  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  31.14 
 
 
289 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  28.09 
 
 
317 aa  89.7  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 
287 aa  89.4  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  31.86 
 
 
283 aa  89.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  31.12 
 
 
289 aa  89.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  30.2 
 
 
305 aa  87  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  32.15 
 
 
302 aa  85.9  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  30.95 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  31.82 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  30.36 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  40.48 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  30.07 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  35.22 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>