More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4985 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  100 
 
 
275 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  62.45 
 
 
275 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  43.54 
 
 
295 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  44.03 
 
 
295 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  44.03 
 
 
295 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  44.03 
 
 
295 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  41.22 
 
 
297 aa  180  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  40 
 
 
295 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  44.63 
 
 
292 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  44.63 
 
 
292 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  44.63 
 
 
292 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  43.34 
 
 
297 aa  175  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  43.48 
 
 
294 aa  174  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  43.73 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 
294 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  42.67 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  42.67 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  41 
 
 
294 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  41 
 
 
294 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  42.71 
 
 
293 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  41.22 
 
 
293 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  41.38 
 
 
293 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 
293 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  41.03 
 
 
293 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  41.69 
 
 
294 aa  159  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  40.62 
 
 
297 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  42.47 
 
 
295 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  39.66 
 
 
341 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  39.32 
 
 
341 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  39.32 
 
 
341 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  41.32 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  39.73 
 
 
298 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 
298 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 
298 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  38.46 
 
 
317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  45.45 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  38.52 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  36.93 
 
 
289 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 
294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  35.17 
 
 
347 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  38.1 
 
 
299 aa  116  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  36.86 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  35.69 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  37.97 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.04 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
293 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  35.69 
 
 
289 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  35.44 
 
 
288 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  34.98 
 
 
285 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 
290 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  35.44 
 
 
288 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  36.82 
 
 
322 aa  104  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.36 
 
 
299 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  36.75 
 
 
277 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.52 
 
 
284 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  35.84 
 
 
303 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
289 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  35.57 
 
 
323 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  35.86 
 
 
294 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  36.51 
 
 
308 aa  99.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  38.54 
 
 
373 aa  99  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  35.86 
 
 
324 aa  98.6  9e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  42.27 
 
 
315 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  36.82 
 
 
304 aa  95.5  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  34.38 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  34.75 
 
 
273 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.24 
 
 
288 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  36.92 
 
 
291 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
296 aa  93.2  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  41.29 
 
 
393 aa  92.4  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  35.15 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  33.33 
 
 
303 aa  92  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  31.91 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  31.88 
 
 
317 aa  90.9  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  31.34 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  32.78 
 
 
305 aa  87  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  35.74 
 
 
321 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  34.9 
 
 
310 aa  86.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  31.14 
 
 
341 aa  85.9  7e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  31.38 
 
 
296 aa  85.9  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  37.41 
 
 
274 aa  85.5  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  34.46 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  35.31 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  32.73 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  33.22 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  32.98 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  31.96 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  33.92 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  34.9 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  32 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  32 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  33.21 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  29.63 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  35.11 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  31.6 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>