More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1901 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 295 aa  567  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  91.16 
 
 		 294 aa  490  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  56.51 
 
 		 293 aa  265  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  55.82 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  45.89 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  48.26 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  42.01 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  45.39 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  44.33 
 
 		 288 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  43.4 
 
 		 291 aa  185  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  41.46 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  44.71 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  42.11 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  43.89 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  43 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  48.94 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  42.27 
 
 		 288 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  39.32 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  43.66 
 
 		 282 aa  175  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  42.27 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  40.35 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  41.34 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  42.14 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  39.86 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  40.13 
 
 		 294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  46.9 
 
 		 288 aa  165  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  42.01 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  42.01 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  46.88 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  41.24 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  38.6 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  39.26 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  42.12 
 
 		 292 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  38.67 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  40.77 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  39.87 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  39.87 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  39.87 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  38.91 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  42.32 
 
 		 277 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  38.46 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  47.57 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  39.39 
 
 		 294 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  38.61 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  38.93 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  41.61 
 
 		 373 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 		 297 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  36.48 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 289 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  36.16 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  36.16 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  41.58 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  42.52 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  41.25 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  41.25 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  40.07 
 
 		 321 aa  148  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  38.98 
 
 		 317 aa  145  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  39.77 
 
 		 393 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  41.24 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  40.97 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  37.46 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  40.48 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  40.96 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1534  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  39.02 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  39.02 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  39.02 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  38.59 
 
 		 339 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  41.03 
 
 		 285 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  40.14 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  40 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  36.91 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  35.4 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3041  putative stress-inducible protein  38.25 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.921902  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  39.34 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  36.58 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  37.5 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  41.06 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  39.24 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  37.63 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  37.42 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  36.99 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  35.2 
 
 		 304 aa  125  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  37.81 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  37.71 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  36.3 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  32.76 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  36.61 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>