269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4842 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  444  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  45.29 
 
 
293 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  44.69 
 
 
293 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  43.36 
 
 
298 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  43.91 
 
 
293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  43.86 
 
 
283 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  45.37 
 
 
296 aa  148  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  44.26 
 
 
291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  43.6 
 
 
292 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  41.89 
 
 
299 aa  144  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  43.89 
 
 
290 aa  142  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  43.17 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.82 
 
 
288 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  42.73 
 
 
393 aa  138  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  43.61 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  41.48 
 
 
287 aa  134  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  39.91 
 
 
288 aa  134  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  42.34 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  40.93 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  44.3 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  40.74 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  40.51 
 
 
289 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3041  putative stress-inducible protein  42.34 
 
 
325 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.921902  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  40.43 
 
 
301 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
296 aa  128  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  39.13 
 
 
373 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
289 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  41.99 
 
 
287 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
296 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  35.87 
 
 
297 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  45.18 
 
 
295 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
296 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  39.47 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  39.04 
 
 
293 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 
293 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  37.61 
 
 
295 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  34.36 
 
 
289 aa  114  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  36.64 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  40.09 
 
 
285 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  39.23 
 
 
293 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  39.91 
 
 
291 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  35.71 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  35.14 
 
 
347 aa  109  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  36.36 
 
 
307 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
295 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  36.7 
 
 
341 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  36.7 
 
 
341 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 
294 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  37.23 
 
 
341 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  37.84 
 
 
298 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  37.21 
 
 
294 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 
298 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  42.72 
 
 
289 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  37.21 
 
 
294 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  36.24 
 
 
294 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
294 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
294 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
297 aa  102  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  37.39 
 
 
298 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  37.23 
 
 
303 aa  102  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  36.2 
 
 
293 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  37.61 
 
 
290 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  40.38 
 
 
277 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  35.32 
 
 
302 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  36.29 
 
 
298 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  36.29 
 
 
298 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  36.29 
 
 
298 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  36.15 
 
 
294 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  35.29 
 
 
297 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  32.62 
 
 
295 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  33.91 
 
 
317 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
295 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
295 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  39.25 
 
 
276 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  36.7 
 
 
292 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  36.7 
 
 
292 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  36.7 
 
 
292 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  37.99 
 
 
315 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  37.38 
 
 
301 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  38.92 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  39.09 
 
 
286 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  37.77 
 
 
309 aa  92.4  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  35.38 
 
 
295 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  34.98 
 
 
321 aa  92  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  33.76 
 
 
304 aa  91.7  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  36.8 
 
 
299 aa  90.9  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  36.68 
 
 
291 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  39.3 
 
 
323 aa  89.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  37.61 
 
 
296 aa  89.4  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  36.17 
 
 
300 aa  88.2  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  36.6 
 
 
297 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  33.33 
 
 
302 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  35.65 
 
 
292 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  39.58 
 
 
301 aa  85.5  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  33.77 
 
 
305 aa  85.1  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  31.98 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  34.22 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  33.76 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  33.2 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>