More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3658 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  100 
 
 
296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  62.5 
 
 
296 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  49.66 
 
 
296 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  46.74 
 
 
293 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  45.49 
 
 
293 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  46.6 
 
 
298 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  46.23 
 
 
291 aa  182  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  43.54 
 
 
289 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  44.14 
 
 
288 aa  171  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  41.31 
 
 
293 aa  146  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  39.5 
 
 
305 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 
296 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  41.92 
 
 
277 aa  142  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  37.8 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  36.73 
 
 
293 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
293 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  38.51 
 
 
308 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  35.79 
 
 
287 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 
277 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.47 
 
 
288 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  34.33 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  37.09 
 
 
305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.76 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  34.33 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 
290 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  36.68 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
294 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  33.91 
 
 
294 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  33.91 
 
 
294 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  36.07 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  43.32 
 
 
276 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  41.03 
 
 
307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  34.92 
 
 
297 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  38.76 
 
 
321 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  37.33 
 
 
310 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  35.05 
 
 
347 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  34.72 
 
 
301 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  39.19 
 
 
323 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
289 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  36 
 
 
289 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  34.92 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  35.83 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  37.89 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  34.92 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  34.92 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.32 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  34.12 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  35.74 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  34.45 
 
 
295 aa  118  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  36.97 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  35.47 
 
 
297 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  32.67 
 
 
341 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 
293 aa  116  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
293 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  36.27 
 
 
292 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.85 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  33.68 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  35.93 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  35.93 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  35.62 
 
 
229 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  34.58 
 
 
296 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  35.15 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  32.09 
 
 
295 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  37.17 
 
 
339 aa  113  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  33.44 
 
 
289 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  35.84 
 
 
314 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 
287 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  37.84 
 
 
324 aa  112  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
289 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  32.08 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  33.77 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  38.31 
 
 
300 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  30.98 
 
 
345 aa  109  7.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  33.9 
 
 
277 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  37 
 
 
294 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  37 
 
 
294 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  34.23 
 
 
300 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  37 
 
 
294 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  33.78 
 
 
277 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  34.01 
 
 
283 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  34.77 
 
 
308 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  36.07 
 
 
302 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  35.88 
 
 
302 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  36.08 
 
 
293 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  37.24 
 
 
373 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  33.89 
 
 
309 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  33.68 
 
 
281 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  37.24 
 
 
274 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  38.57 
 
 
285 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  33.12 
 
 
302 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  33.11 
 
 
303 aa  102  8e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  30.62 
 
 
306 aa  102  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
295 aa  102  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  31.95 
 
 
304 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  30.8 
 
 
295 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  30.77 
 
 
317 aa  99  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  45.07 
 
 
155 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>