More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0292 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  100 
 
 		 303 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  38 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.39 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  35.29 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.21 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  35.47 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  35.88 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  37.88 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  35.42 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  35.41 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  35.4 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  36.07 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  35.67 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  35.74 
 
 		 295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  34.19 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  35.47 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  34.63 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  36.79 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  35.43 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  36.61 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  35.95 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  36.03 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  35.47 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  35.47 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  35.69 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  36.95 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  33.56 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  33.22 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  35.2 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  40 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  36.31 
 
 		 343 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  33.89 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  35.71 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  35.62 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  36.55 
 
 		 292 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 292 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  36.61 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  34.01 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  36.21 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.59 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  33.89 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 		 298 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  33.67 
 
 		 298 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 		 298 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  32.65 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  30.79 
 
 		 341 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  30.79 
 
 		 341 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  32.3 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  34.59 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4449  hypothetical protein  33.95 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  31.86 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  32.78 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  32.2 
 
 		 296 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  33.56 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  36.55 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  46.72 
 
 		 144 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  30.11 
 
 		 381 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.47 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  30.74 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  32.01 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  34.83 
 
 		 301 aa  95.9  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  29.59 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  32.53 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  33.44 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  35.76 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  34.24 
 
 		 347 aa  93.2  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  34.6 
 
 		 348 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  31.44 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  28.96 
 
 		 341 aa  92.8  6e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  33 
 
 		 291 aa  92.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  34.13 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  29.29 
 
 		 345 aa  91.7  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  31.1 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  41.83 
 
 		 144 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  33.9 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  31.91 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  46.26 
 
 		 155 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  37.07 
 
 		 274 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 300 aa  89.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  46.32 
 
 		 143 aa  89.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  31.79 
 
 		 281 aa  89.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  31.49 
 
 		 294 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  36.61 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  34.24 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>