More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1412 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  585  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  53.82 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  45.17 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  42.43 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  45.61 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  39.93 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  41.72 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  44.34 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  38.44 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.93 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  38.67 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  37.33 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  37.83 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  41.47 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  38.74 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  39.53 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  40.27 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  38.49 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  39.26 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.8 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  40.34 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  38.54 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  36.88 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  41.89 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  38.78 
 
 		 339 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  37.84 
 
 		 285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  39.32 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4144  UspA domain protein  42.24 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  37.5 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  36.15 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.38 
 
 		 299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  38.11 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  37.22 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  40.48 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  40.66 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  37.79 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  35.81 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  37.79 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  44.55 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  36.36 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  37.46 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  39.53 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  34.92 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  45.45 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  38.1 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  37.79 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  37.79 
 
 		 294 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  35.96 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  37.79 
 
 		 294 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  35.31 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  36.83 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  38.26 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  36.79 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  35.18 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  36.39 
 
 		 289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  37.04 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  34.6 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  36.84 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 381 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  35.83 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  37.63 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  35.25 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  32.67 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  32.67 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  37.54 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1638  UspA domain protein  37.2 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  35.79 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  34.98 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  33.98 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  35.97 
 
 		 324 aa  106  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  36.54 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  36.27 
 
 		 294 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  37.9 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  36.27 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  36.27 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  33.56 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  38.14 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  36.58 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1072  hypothetical protein  37.25 
 
 		 316 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1088  UspA domain-containing protein  37.25 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103411  normal  0.107054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  36.73 
 
 		 299 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  34.3 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  34.22 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  37.95 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4449  hypothetical protein  32.82 
 
 		 311 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  35.74 
 
 		 293 aa  99  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  32.44 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>