More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3475 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  100 
 
 
291 aa  567  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  65.74 
 
 
293 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  62.15 
 
 
293 aa  349  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  54.51 
 
 
298 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  44.98 
 
 
296 aa  221  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  46.23 
 
 
296 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  44.33 
 
 
294 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  42.36 
 
 
296 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  45.83 
 
 
296 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  42.01 
 
 
293 aa  172  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 
288 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.12 
 
 
299 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  39.93 
 
 
289 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  41.18 
 
 
295 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  37.72 
 
 
297 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  40.14 
 
 
295 aa  159  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  38.72 
 
 
341 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  38.38 
 
 
341 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  38.38 
 
 
341 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  43.4 
 
 
295 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  38.28 
 
 
292 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  39.12 
 
 
294 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  38.64 
 
 
293 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  40.27 
 
 
293 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 
293 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 
293 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  38.91 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  38.91 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  38.91 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.46 
 
 
288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  38.75 
 
 
288 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  41.87 
 
 
294 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  44.02 
 
 
229 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  37.8 
 
 
293 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  38.7 
 
 
294 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  38.7 
 
 
294 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  38.01 
 
 
277 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  40.69 
 
 
301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  37.04 
 
 
287 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  42.71 
 
 
323 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  35.55 
 
 
317 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  37.88 
 
 
292 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  37.88 
 
 
292 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  37.54 
 
 
292 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 
277 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  39.32 
 
 
297 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  42.5 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
289 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
290 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  35.54 
 
 
297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  38.54 
 
 
289 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  39.79 
 
 
305 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  36.91 
 
 
294 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  38.44 
 
 
291 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  36.95 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  35.93 
 
 
289 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 
294 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 
295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  38.59 
 
 
294 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  38.59 
 
 
294 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  43.37 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  36.54 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  35.71 
 
 
347 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  41.08 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  36.3 
 
 
298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 
296 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  37.67 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  37.93 
 
 
373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  37.15 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  37.24 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  38.81 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  39.47 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  33.45 
 
 
315 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  38.6 
 
 
277 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  35.27 
 
 
290 aa  125  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  37.67 
 
 
300 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  34.35 
 
 
281 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  36.33 
 
 
298 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  38.75 
 
 
285 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  36.33 
 
 
298 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  39.93 
 
 
315 aa  122  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  35.99 
 
 
298 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  42.27 
 
 
276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  39.51 
 
 
290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  37.63 
 
 
303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  40.07 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  38.1 
 
 
303 aa  118  9e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  37.25 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  38.64 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  34.36 
 
 
289 aa  116  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  43.06 
 
 
301 aa  116  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3041  putative stress-inducible protein  37.93 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.921902  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  35.12 
 
 
317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  37.55 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  37.72 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>