More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0357 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  586  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4144  UspA domain protein  55.99 
 
 
307 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  43.31 
 
 
305 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  39.02 
 
 
301 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  43.42 
 
 
321 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.07 
 
 
288 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  39.74 
 
 
288 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.66 
 
 
299 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  38.61 
 
 
294 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  38.61 
 
 
294 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  38.49 
 
 
294 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  37.71 
 
 
293 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 
293 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  37.62 
 
 
293 aa  148  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  39.62 
 
 
292 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  39.62 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  39.62 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  36.24 
 
 
295 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  36.75 
 
 
293 aa  145  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  38.56 
 
 
308 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 
297 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  36.45 
 
 
296 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  40.48 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  38 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  37.54 
 
 
296 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  40.07 
 
 
308 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 
289 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  37.67 
 
 
293 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 
293 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 
295 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  36.54 
 
 
317 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  36.82 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  41.08 
 
 
307 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  35.76 
 
 
317 aa  135  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  38.59 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  37.58 
 
 
296 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  35.45 
 
 
287 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  36.27 
 
 
295 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  35.14 
 
 
295 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 
295 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 
295 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  38.23 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  37.97 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  35.76 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  40.34 
 
 
290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  36.58 
 
 
294 aa  129  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  35.93 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  35.69 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  41.54 
 
 
293 aa  126  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  34.11 
 
 
347 aa  126  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  36.95 
 
 
301 aa  126  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  39 
 
 
277 aa  125  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  36.39 
 
 
277 aa  126  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  36.91 
 
 
310 aa  125  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  35.12 
 
 
341 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 
288 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  34.78 
 
 
341 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 
341 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38 
 
 
284 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 
296 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  37.26 
 
 
294 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  36.18 
 
 
303 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  38 
 
 
302 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  36.94 
 
 
294 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  40.61 
 
 
289 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  36.94 
 
 
294 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
289 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  36.63 
 
 
373 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  35.59 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  36.91 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  36.45 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  36.95 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  33.89 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  36.77 
 
 
304 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  37.11 
 
 
277 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  41.08 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  35.47 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  32.56 
 
 
290 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  30.36 
 
 
345 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  37.9 
 
 
294 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  35.91 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  31.55 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  36.12 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1638  UspA domain protein  40.86 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  36.58 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  35.59 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  35.49 
 
 
298 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.67 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  36.93 
 
 
339 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  36.7 
 
 
314 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  38.26 
 
 
299 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  34.65 
 
 
296 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>