More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1986 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  100 
 
 
317 aa  630  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  65.13 
 
 
305 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  67 
 
 
305 aa  355  7.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  60.52 
 
 
308 aa  351  8e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  59.42 
 
 
310 aa  333  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  41.14 
 
 
345 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  41.2 
 
 
341 aa  208  1e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  42.53 
 
 
343 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  42.12 
 
 
348 aa  188  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  37.78 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  35.93 
 
 
289 aa  145  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  36.07 
 
 
293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  32.68 
 
 
303 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  37.97 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  37.54 
 
 
305 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  36.04 
 
 
321 aa  129  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  35.67 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  34.98 
 
 
296 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  35.74 
 
 
296 aa  126  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 
293 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
295 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  34.54 
 
 
292 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  34.54 
 
 
292 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  35.71 
 
 
308 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 
292 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  35.93 
 
 
277 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  32.34 
 
 
297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  32.32 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  33.76 
 
 
296 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  34.9 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  35.88 
 
 
303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  35.28 
 
 
294 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  35.28 
 
 
294 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  35.31 
 
 
294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  32.57 
 
 
288 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  32.79 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  33.77 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  32.79 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  32.79 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.87 
 
 
288 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  33.89 
 
 
294 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  34.42 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  32.3 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  31.48 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
296 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  31.06 
 
 
341 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 
341 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  27.24 
 
 
449 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  35.45 
 
 
302 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  38.6 
 
 
277 aa  106  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  32.8 
 
 
288 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  34.24 
 
 
294 aa  105  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  30.85 
 
 
293 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  32.62 
 
 
292 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  30.59 
 
 
306 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  32.9 
 
 
297 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.56 
 
 
299 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  32.88 
 
 
285 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.73 
 
 
284 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  33 
 
 
293 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  32.67 
 
 
293 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  31.23 
 
 
295 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
293 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  35.31 
 
 
298 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  31.6 
 
 
298 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 
289 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  31.73 
 
 
297 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  30.74 
 
 
295 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  31.48 
 
 
301 aa  96.3  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 
276 aa  95.9  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  32.48 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  34.55 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  32.58 
 
 
381 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  30.23 
 
 
289 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  30.65 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  29.53 
 
 
347 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30980  universal stress protein UspA-like protein  33.45 
 
 
334 aa  94  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.34325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  33.23 
 
 
294 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  33 
 
 
293 aa  93.2  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  36.54 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  30.82 
 
 
373 aa  92.4  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 
290 aa  92.4  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  31.53 
 
 
290 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  32.06 
 
 
298 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  40 
 
 
143 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
296 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  32.06 
 
 
298 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  31.11 
 
 
304 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  31 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  33.12 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  35.48 
 
 
313 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 
293 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.58 
 
 
288 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  29.65 
 
 
289 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  29.94 
 
 
302 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  29.9 
 
 
287 aa  90.5  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>