More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4804 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  100 
 
 
299 aa  593  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  61.15 
 
 
282 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  60.64 
 
 
283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  49.64 
 
 
288 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  50.35 
 
 
289 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  50 
 
 
288 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  56.79 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  47.02 
 
 
301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  48.41 
 
 
291 aa  215  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  47.55 
 
 
292 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  45.1 
 
 
287 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  46.07 
 
 
290 aa  193  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  45.13 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  45.13 
 
 
288 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  44.72 
 
 
287 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  40.21 
 
 
289 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  39.26 
 
 
288 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  36.59 
 
 
289 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  42.01 
 
 
294 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 
293 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  42.61 
 
 
296 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  38.54 
 
 
293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  42.6 
 
 
293 aa  155  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
298 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  38.13 
 
 
295 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
293 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  37.54 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  42.09 
 
 
285 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  39.12 
 
 
291 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  36.33 
 
 
341 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  41.11 
 
 
292 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  36.01 
 
 
341 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  41.16 
 
 
303 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  36.01 
 
 
341 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  36.42 
 
 
317 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
297 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  40.77 
 
 
292 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  39.04 
 
 
298 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  40.77 
 
 
292 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 
298 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 
298 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  39.58 
 
 
295 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 
295 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 
295 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  41.89 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  42.81 
 
 
274 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  38 
 
 
294 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  37.67 
 
 
294 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 
294 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  37.41 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  38.33 
 
 
289 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  34.13 
 
 
296 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  37.11 
 
 
297 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  40.96 
 
 
296 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  37.54 
 
 
277 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  38.18 
 
 
295 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  39.81 
 
 
323 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  35.96 
 
 
297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  39.26 
 
 
294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  39.86 
 
 
307 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  35.89 
 
 
347 aa  129  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  38.93 
 
 
294 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 
294 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  35.74 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  43.1 
 
 
286 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  38.98 
 
 
300 aa  125  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  34.02 
 
 
295 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
294 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  36.21 
 
 
303 aa  125  9e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  35.49 
 
 
296 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  37.07 
 
 
321 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  36.78 
 
 
393 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
297 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  36.27 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  36.71 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  38.28 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  42.11 
 
 
295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  37.11 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  33.76 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  35.1 
 
 
305 aa  119  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  38.85 
 
 
339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  44.39 
 
 
301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  33.69 
 
 
281 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  36.09 
 
 
310 aa  116  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  34.26 
 
 
290 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  33.88 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  33.22 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  35 
 
 
302 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  38.79 
 
 
276 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  36.61 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  36.75 
 
 
305 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  38.16 
 
 
292 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  36.58 
 
 
314 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>