More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4144 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4144  UspA domain protein  100 
 
 		 307 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  55.99 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  41.5 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.88 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  36.69 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  42.22 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  38.49 
 
 		 294 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  36.39 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  34.77 
 
 		 347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  39.41 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  36.33 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  42.03 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.33 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  39.47 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  35.2 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  33.56 
 
 		 287 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  39.6 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  36.86 
 
 		 307 aa  119  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  35.13 
 
 		 293 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 289 aa  119  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  37.93 
 
 		 373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  33.89 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  37.01 
 
 		 296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  31.67 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  34.67 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  36 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  37.09 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  34.54 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  33.23 
 
 		 294 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  36.27 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  36.48 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  36.48 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  36.48 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  33.02 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  33.23 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  33.23 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  33.23 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  36.25 
 
 		 283 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  35.08 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  35.64 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  34.22 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  32.69 
 
 		 317 aa  105  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.13 
 
 		 284 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  35.74 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  35.74 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  34.1 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1638  UspA domain protein  40.8 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  35.41 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  31.61 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  36.6 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  34.65 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  35.31 
 
 		 323 aa  102  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  36.12 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  32.33 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  32.48 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  35.77 
 
 		 393 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  32.89 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  34.22 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  37.54 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  30.74 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  34.77 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  34.55 
 
 		 314 aa  99.4  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  38.81 
 
 		 294 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  33.44 
 
 		 301 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  38.33 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  38.34 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  38.34 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  33.33 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  31.56 
 
 		 341 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  31.23 
 
 		 341 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  31.23 
 
 		 341 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  34.44 
 
 		 288 aa  95.5  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  34.53 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  35 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  30.77 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  32.18 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  33.95 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  34.2 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  34.5 
 
 		 339 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.79 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 297 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  31.85 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  29.71 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  34.88 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  43.17 
 
 		 143 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1833  UspA domain protein  33.77 
 
 		 342 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0847869  normal  0.369126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  37.13 
 
 		 295 aa  89  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  36.36 
 
 		 229 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  33.44 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  35.31 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>