More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22880 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 
303 aa  595  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  42.47 
 
 
347 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  42.95 
 
 
288 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  42.28 
 
 
289 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  43.45 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  40.61 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  42.32 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  47.06 
 
 
323 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  41.81 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  39.25 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  41.16 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  39.25 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  39.25 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  42.16 
 
 
296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  40.41 
 
 
291 aa  162  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  45.89 
 
 
274 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 
293 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  40.75 
 
 
293 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 
289 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  40.75 
 
 
373 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  38.98 
 
 
293 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  41.69 
 
 
292 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  37.17 
 
 
305 aa  155  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  39.34 
 
 
302 aa  155  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  37.37 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  39.25 
 
 
294 aa  153  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 
277 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  38.01 
 
 
295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  33.66 
 
 
317 aa  152  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  42.23 
 
 
284 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  38.05 
 
 
297 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  36.39 
 
 
295 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  36.95 
 
 
294 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  43.3 
 
 
393 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  36.95 
 
 
294 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  39.19 
 
 
308 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  36.95 
 
 
297 aa  149  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  38.89 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  38.59 
 
 
282 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  39.27 
 
 
298 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  36.33 
 
 
296 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  40.83 
 
 
277 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  37.46 
 
 
287 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
295 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  38.87 
 
 
290 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  38.94 
 
 
298 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  39.02 
 
 
277 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  38.94 
 
 
298 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  37.58 
 
 
294 aa  142  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  38.23 
 
 
298 aa  142  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  40.82 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  37.46 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  42.27 
 
 
295 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  39.26 
 
 
321 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  38.91 
 
 
287 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  35.86 
 
 
317 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  40.61 
 
 
299 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  37.8 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  37.8 
 
 
293 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  37.8 
 
 
293 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
289 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  37.42 
 
 
303 aa  135  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  34.77 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  35.76 
 
 
304 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  34.77 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  36.49 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  41.81 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  38.97 
 
 
300 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  34.32 
 
 
296 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  39.18 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  37.46 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  34.45 
 
 
341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  35.19 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  36.61 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  37.63 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  36.64 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  31.77 
 
 
345 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  36.68 
 
 
275 aa  126  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  36.09 
 
 
294 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  36.09 
 
 
294 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  36.79 
 
 
305 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  37.2 
 
 
339 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  35.91 
 
 
298 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  35.91 
 
 
298 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  34.77 
 
 
296 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  35.91 
 
 
298 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  40.82 
 
 
315 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
294 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  39.59 
 
 
301 aa  122  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 
275 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  35.86 
 
 
302 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  35.93 
 
 
286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  35.45 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3041  putative stress-inducible protein  37.63 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.921902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>