More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0328 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  590  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  590  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  99.33 
 
 		 298 aa  587  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1072  hypothetical protein  45.42 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1088  UspA domain-containing protein  45.42 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103411  normal  0.107054 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  40.41 
 
 		 289 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  38.94 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  37.54 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  38.75 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  33.1 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  35.35 
 
 		 347 aa  135  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  34.67 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  34.64 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.56 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  34.81 
 
 		 321 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  36.01 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  34.9 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  34.26 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  36.58 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  36.11 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  30.3 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  34.69 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  36.21 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  37.16 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  32.76 
 
 		 297 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  31.49 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 		 289 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  30.27 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  30.27 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  30.27 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.19 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  30.82 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  31.77 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.64 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  34.15 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  36.46 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  30.82 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  34.36 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  30.48 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  37.19 
 
 		 274 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 292 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  32.19 
 
 		 292 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  35.71 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  33 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 292 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  34.97 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  32.79 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  31.42 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  31.42 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  33.89 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.8 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 		 289 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  31.02 
 
 		 341 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  30.64 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  30.64 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  31.51 
 
 		 288 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  30.79 
 
 		 306 aa  102  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  33.33 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  36.61 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  35.03 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  37.84 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  31.33 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 275 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  32.09 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  37.04 
 
 		 393 aa  96.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  34.27 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 296 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  31.94 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  32.67 
 
 		 309 aa  95.5  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  30.69 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  29.74 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  34.59 
 
 		 277 aa  93.6  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  30.69 
 
 		 290 aa  92.4  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  31.79 
 
 		 302 aa  92.4  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  30.7 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  32.99 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  31.25 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 271 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>