249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0118 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 381 aa  721    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4449  hypothetical protein  50.72 
 
 		 311 aa  248  8e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  38.55 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  33.81 
 
 		 305 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  34.01 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  32.95 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  33.14 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  32.68 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  34.59 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.51 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  35.91 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  30.4 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  29.92 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  31.92 
 
 		 288 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 		 289 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  31.69 
 
 		 310 aa  96.7  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  33.14 
 
 		 305 aa  96.3  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  28.12 
 
 		 341 aa  96.3  7e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  30.4 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  32.58 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  30.68 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  30.4 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  30.4 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  30.29 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  32.48 
 
 		 293 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 296 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  30 
 
 		 341 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 341 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2140  hypothetical protein  37.99 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  33.62 
 
 		 302 aa  93.2  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  27.75 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.77 
 
 		 299 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  31.81 
 
 		 288 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  31.32 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  30.37 
 
 		 292 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  31.82 
 
 		 295 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 295 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 295 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  31.01 
 
 		 285 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  30.81 
 
 		 297 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  31.41 
 
 		 287 aa  87.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  29.83 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  28.74 
 
 		 289 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  31.32 
 
 		 277 aa  86.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  31.71 
 
 		 298 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 		 298 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 		 298 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  30.11 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  30.55 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  30.03 
 
 		 323 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  28.86 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  30.68 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  30.64 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  35.98 
 
 		 143 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  29.66 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  32.01 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  42.68 
 
 		 155 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  32.58 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  29.81 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  29.81 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  29.38 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  28.45 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  29.81 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.55 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.55 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  29.43 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  29.55 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  31.4 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  33.94 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  30.55 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  29.39 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  30.11 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  31.13 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  36.99 
 
 		 147 aa  77.4  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  29.54 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  34.36 
 
 		 144 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  32.16 
 
 		 148 aa  75.5  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  33.2 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  29.91 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  28.81 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  30.43 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  37.13 
 
 		 144 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  30.09 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  27.65 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  30.46 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  32.96 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  32.66 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  31.35 
 
 		 301 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  29.49 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 151 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>