More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4805 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  37.15 
 
 
289 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  37.89 
 
 
296 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  37.63 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 
289 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  37.89 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  35.52 
 
 
295 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  35.52 
 
 
295 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  35.52 
 
 
295 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 
293 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  35.99 
 
 
288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.24 
 
 
288 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  35.12 
 
 
293 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.44 
 
 
284 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.59 
 
 
299 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
290 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  38.06 
 
 
298 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  36.82 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  37.76 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  35.71 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  37.33 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  36.46 
 
 
303 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  37.28 
 
 
288 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  34.74 
 
 
297 aa  112  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  34.58 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  35.76 
 
 
294 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
294 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 
293 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  34.51 
 
 
293 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
293 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 
297 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 
294 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 
289 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 
293 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  36.71 
 
 
291 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  35.54 
 
 
291 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  35.44 
 
 
282 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  33.22 
 
 
294 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
294 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  32.53 
 
 
289 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  37.82 
 
 
287 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
277 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  37.06 
 
 
339 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  38.49 
 
 
285 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  34.16 
 
 
281 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  34.14 
 
 
295 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  38.81 
 
 
296 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
294 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  35.09 
 
 
292 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  35.09 
 
 
292 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  32.98 
 
 
290 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.38 
 
 
288 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  35.09 
 
 
292 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
275 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
293 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  35.02 
 
 
299 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  33.21 
 
 
301 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  32.63 
 
 
297 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  33.9 
 
 
289 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  35.56 
 
 
287 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  35.27 
 
 
294 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  32.18 
 
 
321 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  34.49 
 
 
294 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  32.2 
 
 
341 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  31.08 
 
 
317 aa  99  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  32.06 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  31.85 
 
 
341 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  36.62 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  31.5 
 
 
315 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 
341 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  35.47 
 
 
302 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  32.53 
 
 
289 aa  96.3  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  35.27 
 
 
307 aa  95.9  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  34.74 
 
 
296 aa  95.9  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  34.53 
 
 
288 aa  95.5  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  33.94 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  31.46 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  34.52 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
290 aa  93.2  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  36.86 
 
 
323 aa  93.2  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  33.94 
 
 
277 aa  93.2  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  34.22 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3300  UspA domain protein  33.57 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176121  normal  0.0128083 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  33.33 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  33.77 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  39.8 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  32.33 
 
 
306 aa  89.4  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  33.21 
 
 
277 aa  89  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  30.72 
 
 
303 aa  89  9e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  38.3 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  33.56 
 
 
314 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  32.04 
 
 
298 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  32.04 
 
 
298 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  32.04 
 
 
298 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
295 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>