More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2388 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  100 
 
 
293 aa  567  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  84.93 
 
 
296 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  55.17 
 
 
294 aa  270  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  56.51 
 
 
295 aa  245  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  45.83 
 
 
293 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  46.58 
 
 
289 aa  196  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  45.21 
 
 
288 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  41.44 
 
 
293 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  41.55 
 
 
299 aa  178  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  39.51 
 
 
347 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  38.44 
 
 
296 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  44.44 
 
 
298 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  40.28 
 
 
288 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  42.01 
 
 
291 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  40.48 
 
 
288 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  42.16 
 
 
282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  39.53 
 
 
289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  41.67 
 
 
303 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  39.93 
 
 
289 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  38.44 
 
 
296 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  43.26 
 
 
284 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  38.31 
 
 
289 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 
295 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  36.91 
 
 
295 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 
295 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  45.29 
 
 
229 aa  158  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  41.18 
 
 
290 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  40.21 
 
 
287 aa  155  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
296 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  41.61 
 
 
292 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  41.87 
 
 
291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  38.25 
 
 
289 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  42.16 
 
 
288 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  39.51 
 
 
283 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  39.25 
 
 
294 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  39.25 
 
 
294 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  39.65 
 
 
277 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  39.25 
 
 
294 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  44.59 
 
 
323 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  41.11 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  37.84 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  40.61 
 
 
393 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 
293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  37.89 
 
 
287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  37.92 
 
 
295 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  37.46 
 
 
301 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  34.43 
 
 
293 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  40.28 
 
 
285 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  38.38 
 
 
289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  38.05 
 
 
293 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  37.54 
 
 
297 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  37.11 
 
 
297 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  36.7 
 
 
321 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  37.01 
 
 
305 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  37.72 
 
 
373 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1534  UspA domain-containing protein  37.54 
 
 
274 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  34.59 
 
 
294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  39.6 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3041  putative stress-inducible protein  36.75 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.921902  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  37.92 
 
 
339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  35.16 
 
 
317 aa  129  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  40.07 
 
 
302 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  38.89 
 
 
290 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  38.57 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  38.57 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  34.02 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  33 
 
 
294 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  38.54 
 
 
274 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  36.39 
 
 
294 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  34.42 
 
 
297 aa  125  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  33.11 
 
 
294 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
294 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  43.48 
 
 
276 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  39.31 
 
 
307 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  34 
 
 
298 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  41.84 
 
 
289 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  35.92 
 
 
308 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  34 
 
 
298 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
290 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  34 
 
 
298 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
297 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  36.18 
 
 
277 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  35.18 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  35.76 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  34.9 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  38.97 
 
 
301 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  37.76 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  35.55 
 
 
292 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  37.59 
 
 
291 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  39.6 
 
 
315 aa  119  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  35.55 
 
 
292 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  35.55 
 
 
292 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  33.9 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  36.58 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  37.54 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  36.58 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  37.54 
 
 
271 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1583  UspA domain-containing protein  34.13 
 
 
274 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.932581  normal  0.58518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>