More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1912 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  100 
 
 
155 aa  303  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  55.07 
 
 
144 aa  137  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  47.37 
 
 
144 aa  100  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  47.14 
 
 
143 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  43.57 
 
 
299 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  46.32 
 
 
164 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  40.4 
 
 
302 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  43.17 
 
 
293 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  41.38 
 
 
339 aa  85.5  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  41.13 
 
 
147 aa  83.6  9e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  41.78 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  41.26 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  40.76 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  42.68 
 
 
381 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  47.79 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  44.44 
 
 
303 aa  82  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  43.4 
 
 
292 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  43.4 
 
 
292 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  47.06 
 
 
284 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  42.03 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  42.77 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  43.07 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  41.43 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  40 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  40 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  41.73 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  41.5 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  41.78 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  39.71 
 
 
289 aa  77  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  41.01 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  44.6 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  43.66 
 
 
321 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  39.75 
 
 
308 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  37.01 
 
 
295 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  37.01 
 
 
295 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  37.01 
 
 
295 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  40.71 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 
289 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  39.42 
 
 
282 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  40.41 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  40.15 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  37.14 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4449  hypothetical protein  38.24 
 
 
311 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
294 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 
296 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 
294 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  36.49 
 
 
305 aa  71.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 
295 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  33.99 
 
 
321 aa  70.9  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 
293 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  37.41 
 
 
347 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  40.15 
 
 
290 aa  70.5  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  38.13 
 
 
301 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  37.76 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  42.34 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  37.32 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  38.97 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  40.97 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  42.55 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.41 
 
 
288 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  36.25 
 
 
298 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  36.25 
 
 
298 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 
287 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  36.25 
 
 
298 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  41.91 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  34.01 
 
 
317 aa  68.2  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 
293 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  37.59 
 
 
341 aa  68.2  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  39.86 
 
 
324 aa  67.8  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  33.76 
 
 
315 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  40.58 
 
 
302 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2137  UspA domain-containing protein  43.06 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.221576  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  40.97 
 
 
276 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22870  universal stress protein UspA-like protein  39.71 
 
 
149 aa  67  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.354321 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05020  universal stress protein UspA-like protein  37.58 
 
 
293 aa  67  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1014  UspA domain protein  42.31 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  39.07 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12643  hypothetical protein  37.67 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  39.01 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  38.3 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  41.13 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  41.13 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  41.13 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.33 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
296 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  40 
 
 
296 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  38.73 
 
 
287 aa  65.5  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  37.78 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  39.35 
 
 
293 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  33.57 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  39.35 
 
 
293 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  39.42 
 
 
295 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  35 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>