More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0713 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  99.66 
 
 
294 aa  587  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  100 
 
 
294 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  99.66 
 
 
294 aa  587  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  58.16 
 
 
295 aa  329  4e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  56.46 
 
 
295 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  56.46 
 
 
295 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  56.46 
 
 
295 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  59.39 
 
 
294 aa  308  8e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  54.05 
 
 
297 aa  301  9e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  50 
 
 
295 aa  273  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  51.74 
 
 
297 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  51.68 
 
 
293 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  51.68 
 
 
293 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  51.01 
 
 
293 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  49.33 
 
 
294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  49.83 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  49.49 
 
 
292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  49.49 
 
 
292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  48.14 
 
 
294 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  47.47 
 
 
294 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  47.47 
 
 
294 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  46.96 
 
 
341 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  50.87 
 
 
296 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  46.62 
 
 
341 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  46.62 
 
 
341 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  44.01 
 
 
297 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  45.42 
 
 
293 aa  216  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  45 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  48.96 
 
 
298 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  48.96 
 
 
298 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  48.96 
 
 
298 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  43.05 
 
 
295 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  45.25 
 
 
317 aa  202  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  43.43 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 
275 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  41.64 
 
 
275 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  40.26 
 
 
347 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  43.34 
 
 
373 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  38.87 
 
 
293 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  43.64 
 
 
284 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 
293 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  41.23 
 
 
321 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  40.55 
 
 
277 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.26 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  42.71 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  41.41 
 
 
323 aa  145  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  42.42 
 
 
294 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  44.95 
 
 
288 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  35.64 
 
 
289 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  41.61 
 
 
274 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.79 
 
 
288 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  39.92 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  35.55 
 
 
305 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  43.6 
 
 
315 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  36.45 
 
 
288 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  38.14 
 
 
292 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  39 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  43.94 
 
 
393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  37.5 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  39.07 
 
 
302 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  35.64 
 
 
308 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  39.93 
 
 
298 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  38.1 
 
 
301 aa  129  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
288 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  35.84 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  37.31 
 
 
291 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  34.81 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  36.49 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
289 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  33.89 
 
 
317 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  38.78 
 
 
282 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  32.31 
 
 
296 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  40.91 
 
 
277 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  38.38 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  36.99 
 
 
283 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  34.77 
 
 
304 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  36.68 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  33.9 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  34.02 
 
 
296 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  31.25 
 
 
345 aa  116  6e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  35.03 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  33.22 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  40 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  37.81 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  35.15 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  32.31 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  34.11 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  33.9 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  35.76 
 
 
273 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  36.21 
 
 
299 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  31.65 
 
 
287 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  33.11 
 
 
322 aa  108  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  34.98 
 
 
277 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  35.97 
 
 
302 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  34.88 
 
 
305 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  35.53 
 
 
314 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  35.88 
 
 
293 aa  106  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  41.58 
 
 
295 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>