More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0383 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  100 
 
 
343 aa  679    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  84.06 
 
 
348 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  50.45 
 
 
324 aa  270  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  48.04 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  48.38 
 
 
308 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  47.21 
 
 
305 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  42.86 
 
 
317 aa  230  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  46.41 
 
 
305 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  38.91 
 
 
345 aa  177  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  37.46 
 
 
341 aa  170  4e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  37.78 
 
 
289 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  37.31 
 
 
322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  36.54 
 
 
288 aa  159  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
296 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 
293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  35.58 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  37.62 
 
 
277 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.35 
 
 
288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30980  universal stress protein UspA-like protein  38.11 
 
 
334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.34325  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 
277 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  34.42 
 
 
293 aa  123  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
287 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  36.89 
 
 
296 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  36.71 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  33.87 
 
 
296 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  36.56 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  37.99 
 
 
294 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  33.12 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  34.2 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.97 
 
 
299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  32.7 
 
 
293 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  36.31 
 
 
303 aa  117  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  32.81 
 
 
297 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  37.12 
 
 
321 aa  116  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 
289 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  34.73 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  34.73 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  35.2 
 
 
307 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  34.38 
 
 
294 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  36.66 
 
 
288 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  34.38 
 
 
294 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  33.66 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  34.41 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 
293 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  32.32 
 
 
306 aa  113  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
294 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  32.81 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  36.48 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  33.12 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 
298 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  34.1 
 
 
305 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.5 
 
 
288 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  33.33 
 
 
291 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  35.03 
 
 
302 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  34.28 
 
 
287 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  34.75 
 
 
303 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  35.26 
 
 
308 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 
293 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  33.12 
 
 
294 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  35.13 
 
 
296 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  30.98 
 
 
317 aa  103  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.06 
 
 
284 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  33.02 
 
 
314 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  34.98 
 
 
277 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
290 aa  102  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  32.17 
 
 
287 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  34.94 
 
 
283 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  32.05 
 
 
292 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 
292 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  35.03 
 
 
299 aa  99.8  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  33.54 
 
 
373 aa  99.8  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  33.74 
 
 
294 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  32.62 
 
 
301 aa  99.4  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 
290 aa  99  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1833  UspA domain protein  34.63 
 
 
342 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0847869  normal  0.369126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  33.44 
 
 
291 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  31.73 
 
 
292 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  33.44 
 
 
294 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  32.42 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  33.23 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  33.12 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  32.69 
 
 
347 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 
275 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  33.88 
 
 
275 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  34.19 
 
 
300 aa  96.7  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  38.02 
 
 
291 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  33.33 
 
 
300 aa  96.3  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0192  UspA domain protein  38.51 
 
 
288 aa  95.9  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578579  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  32.42 
 
 
302 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 
289 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  37.01 
 
 
295 aa  94.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>