212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3530 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  100 
 
 
281 aa  556  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  67.26 
 
 
290 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  40.29 
 
 
315 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  37.97 
 
 
293 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  35.64 
 
 
293 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  36.71 
 
 
292 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  35.15 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  33.81 
 
 
287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  34.39 
 
 
301 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.69 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  32.08 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.8 
 
 
288 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  35.59 
 
 
302 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  34.35 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 
297 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  35.89 
 
 
296 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  36.64 
 
 
303 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  36.95 
 
 
323 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 
294 aa  106  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
296 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  33.45 
 
 
288 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
289 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  33.33 
 
 
282 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  34.16 
 
 
273 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  35.09 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  35.69 
 
 
373 aa  99.4  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  32.28 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  31.8 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  31.83 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  34.35 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  34.35 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  34.35 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
292 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  31.65 
 
 
292 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 
292 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
289 aa  95.5  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  30.51 
 
 
293 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 
294 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 
293 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  35.19 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
293 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  31.16 
 
 
294 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 
294 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  30.42 
 
 
288 aa  88.6  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.04 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  36.33 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  31.79 
 
 
303 aa  87  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  28.87 
 
 
297 aa  87  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 
289 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  31.88 
 
 
309 aa  85.9  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  27.3 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  31.25 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  32.63 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  26.96 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  30.53 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  26.96 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  35.92 
 
 
274 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  32.75 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  33.89 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  33.33 
 
 
393 aa  82.4  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  32.42 
 
 
294 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  30.58 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  30.45 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  28.87 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  31.07 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  30.45 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  30.45 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0344  UspA domain-containing protein  30.69 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  28.52 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  34.16 
 
 
287 aa  79  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  30.37 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  30.45 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  35.58 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.11 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  31.61 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  30.47 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  33.33 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  28.81 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  32.13 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  29.31 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1833  UspA domain protein  35.19 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0847869  normal  0.369126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  31.65 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  31.97 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  30 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  32.41 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  38.14 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  27.65 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  34.8 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  30.13 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  31.17 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  28.52 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  28.24 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>