261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3041 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3041  putative stress-inducible protein  100 
 
 		 325 aa  620  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.921902  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1833  UspA domain protein  50.17 
 
 		 342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0847869  normal  0.369126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  41.81 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.02 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  37.15 
 
 		 293 aa  152  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  38.25 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  40.36 
 
 		 290 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.87 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  42.34 
 
 		 229 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  40.64 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.79 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  35.54 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  36.14 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  38.6 
 
 		 294 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  37.1 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  37.63 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  37.98 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  36.4 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  35.31 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  39.65 
 
 		 287 aa  126  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  38.6 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  36.27 
 
 		 298 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  36.9 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  36.88 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  32.65 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  37.98 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  33.45 
 
 		 341 aa  119  6e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  36.84 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  34.47 
 
 		 277 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  35.27 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  33.79 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  34.34 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  30.1 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  37.63 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  31.65 
 
 		 317 aa  105  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  33.65 
 
 		 308 aa  105  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  34.69 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  35.56 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  36.49 
 
 		 393 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  32.77 
 
 		 294 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  38.85 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  33.91 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  33.91 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  34.95 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  33.11 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  32.16 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  33.56 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  35.99 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  35.09 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  34.56 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  32.07 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  35.34 
 
 		 305 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 		 341 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  30.41 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  36.6 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  34.88 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  33.9 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  34.83 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  34.83 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  34.83 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  33.22 
 
 		 293 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 293 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  35 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  32.08 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  34.38 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  33.22 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  38.54 
 
 		 289 aa  93.6  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  31.56 
 
 		 315 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  35.17 
 
 		 315 aa  92.8  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  32.18 
 
 		 290 aa  93.2  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  33.69 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  34.93 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  31.47 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  31.62 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  32.43 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  30.74 
 
 		 281 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 277 aa  90.1  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  30.85 
 
 		 296 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  34.93 
 
 		 322 aa  90.1  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  35.57 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  32.32 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  32.31 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  34.12 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  34.15 
 
 		 288 aa  86.7  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>