More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0519 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  100 
 
 
188 aa  377  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 
155 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  35.53 
 
 
143 aa  84.7  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  36.75 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 
147 aa  73.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2071  UspA domain protein  42.38 
 
 
152 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000068593 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  34.87 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  37.5 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  34.46 
 
 
306 aa  72  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  37.34 
 
 
303 aa  71.6  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  33.33 
 
 
341 aa  71.6  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  39.07 
 
 
293 aa  71.2  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  40.13 
 
 
296 aa  71.2  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  35.67 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 
289 aa  68.6  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.19 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  34.87 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  33.75 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  37.16 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  36.42 
 
 
303 aa  67  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  35.26 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  35.43 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  34.42 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  36.49 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  36.18 
 
 
339 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  32.76 
 
 
322 aa  65.1  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  34 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  39.04 
 
 
305 aa  64.7  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 
287 aa  64.7  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  35.26 
 
 
155 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2072  UspA domain protein  36.36 
 
 
149 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000584159 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  34.1 
 
 
317 aa  63.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  33.53 
 
 
309 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  35.53 
 
 
305 aa  63.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  31.85 
 
 
143 aa  63.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  31.52 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  30.46 
 
 
308 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  35.71 
 
 
310 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2137  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 
147 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.221576  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  33.54 
 
 
288 aa  62.4  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  33.77 
 
 
321 aa  62  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  36 
 
 
313 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  33.55 
 
 
139 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  32.5 
 
 
170 aa  62  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  36.54 
 
 
294 aa  62  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5918  hypothetical protein  37.18 
 
 
152 aa  61.6  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  32.9 
 
 
347 aa  61.6  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  34.87 
 
 
285 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  33.92 
 
 
157 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.41 
 
 
288 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.56 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 
290 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  34.38 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  35.06 
 
 
147 aa  60.5  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.32 
 
 
148 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  34.21 
 
 
308 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  29.73 
 
 
170 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.21 
 
 
149 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 
155 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  29.73 
 
 
170 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  32.93 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  32.72 
 
 
158 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 
138 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
297 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  32.48 
 
 
147 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 
277 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  32.3 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  32.72 
 
 
155 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 
297 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.67 
 
 
149 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  34.59 
 
 
151 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  36.65 
 
 
314 aa  58.9  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30.86 
 
 
320 aa  58.9  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.01 
 
 
288 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  34.59 
 
 
151 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  35.95 
 
 
154 aa  58.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  32.9 
 
 
373 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.05 
 
 
284 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.82 
 
 
155 aa  58.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4023  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 
143 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 
143 aa  58.2  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  33.77 
 
 
147 aa  57.8  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32.16 
 
 
159 aa  57.4  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  35.22 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  30.82 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.03 
 
 
150 aa  57.4  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  30.18 
 
 
151 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  32 
 
 
296 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  33.77 
 
 
287 aa  56.6  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  34.38 
 
 
147 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1902  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 
166 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156681  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.54 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
276 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.32 
 
 
153 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
296 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  32.26 
 
 
152 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 
162 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  31.06 
 
 
155 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>