109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1000 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1000  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 293 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172232  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1005  UspA domain-containing protein  39.56 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.137418  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0988  UspA domain-containing protein  34.24 
 
 		 304 aa  96.7  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0996  UspA domain-containing protein  35.54 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  31.87 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0997  UspA domain-containing protein  31.23 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975908  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.38 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  30.67 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  29.78 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  29.86 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1638  UspA domain protein  30.42 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  31.28 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  33.65 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  33.65 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  31.98 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  33.82 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  28.12 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  30.19 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  26.64 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  30.64 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  30.34 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  30.3 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  30.3 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  30.47 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  28.57 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0192  UspA domain protein  34.29 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578579  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  32.38 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  30.29 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  30.28 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  29.87 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  27.61 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  27.61 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  27.61 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  27.66 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  33.57 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  29.82 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  29.54 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30980  universal stress protein UspA-like protein  30.3 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.34325  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  30.19 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  27.55 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  30.04 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  29.45 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  28.98 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  30.41 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  27.3 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  28.94 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  37.89 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  28.5 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  27.93 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  27.98 
 
 		 341 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  27.98 
 
 		 341 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 		 300 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  27.21 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  26.67 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2069  UspA domain protein  30.26 
 
 		 288 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000374133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  28.93 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  27.88 
 
 		 341 aa  49.3  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0660  UspA domain protein  40.57 
 
 		 302 aa  48.9  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  24.74 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  24.74 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  25.94 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  24.74 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  26.57 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  34.45 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  27.78 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  30.73 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  29.59 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  28.14 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  27.86 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  26.48 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  27.36 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  27.02 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  26.07 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3300  UspA domain protein  29.31 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176121  normal  0.0128083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 		 343 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  30.69 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  27.95 
 
 		 322 aa  46.6  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  45.61 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  30 
 
 		 310 aa  45.8  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  25.24 
 
 		 301 aa  45.8  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  27.31 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  28.64 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  30.81 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18580  universal stress protein UspA-like protein  45.76 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  27.64 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.33 
 
 		 145 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  30.77 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  29.73 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>